Candida spp. - Genotipado: Determinación de genotipo (A, B, C, D o E); secuencias ALT en región genómica RPS; Presencia de microsatélites; MLST (Multilocus Sequencing Typing).

Determinación del genotipo (A, B, C, D o E), mediante comparación del tamaño del amplicón obtenido en la seuencia 25S rDNA.

Determinación del número se secuencias ALT (secuencias cortas de 172 pb), repetidas en región genómica RPS (secuencias repetidas polimórficas).

Determinación de presencia de microsatélites. Para Candida albicans: CDC3, EF3, HIS3, CAI, CAIII, CAIV, CAV, CAVI, CAVII; Para Candida parapsilosis: CP1, CP4, CP6, B5; Para Candida tropicalis: URA3, CT14, Ctrm7, Ctrm10, Ctrm12, Ctrm15, Ctrm21, Ctrm24, Ctrm28.

Comparación de cepas mediante MLST (Multilocus Sequencing Tuping) con hasta 9 loci (AAT1a, ACC1, ADP1, MPI1b, SYA1, VPS13, ZWF1b, AAT1b y RPN2.

 

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