Picornaviridae (Enterovirus A, B, C, D, E, F, G, H, J; Rhinovirus A, B y C; Hepatovirus; Kobuvirus –virus Aichi-; Parechovirus; Cardiovirus; Aphthovirus; Cosavirus; …..)(antes Poliovirus, Coxsackie A y B, Echovirus, …).Diagnóstico por RT-PCR y tipado molecular

 

Información 08-04-14.

 

Picornaviridae (Picornavirus)

            Los Picornaviridae (habitualmente llamados Picornavirus) son unos virus muy numerosos, causantes de enfermedades humanas, en animales, plantas e insectos. Estos virus reciben este nombre por su pequeño tamaño (“pico”) y poseer un genoma de RNA (“pico-rna-virus”). Los Picornavirus causas enfermedades humanas muy distintas, desde procesos respiratorios similares a catarros comunes, a poliomielitis. Estos virus afectan a muchas personas y se encuentran en secreciones respiratorias (saliva, esputo, moco nasal), y heces de personas infectadas. Las especies de cualquiera de las especies de Enterovirus A, B, C, D, o J, se transmiten a través de la vía fecal-oral, y provocan infecciones respiratorias leves (catarros comunes), glosopeda (enfermedad de mano, pie y boca), conjuntivitis hemorrágicas, meningitis asépticas, miocarditis, enfermedad séptica neonatal, y parálisis fláccida.

Se diferenciaron inicialmente dos géneros, Enterovirus y Rhinovirus, basándose en la capacidad de infectar el tracto entérico (por replicarse a 37ºC y ser estables a pH ácido gástrico), o en su capacidad de infectar únicamente nariz y faringe (por replicarse a 33ºC e inactivarse a pH ácido). Los Enterovirus se diferenciaron según su patogenia en cuatro grupos: poliovirus, Coxsackie A (CA), Coxsackie B (CB) y Echovirus (Enteric Cytopathogen Human Orphan). Sin embargo, la superposición de características ha motivado su reclasificación, actualmente basada en estudios filogenéticos. Como ejemplo, los Poliovirus, antes considerada una especie dentro del género Enterovirus, actualmente se considera tres serotipos de la especie Enterovirus humano C. De igual forma, los serotipos de Coxsackie A se han distribuido entre la especie Enterovirus humanos A y Enterovirus humano C. El grupo de Coxsackie B (CB 1 a 6), igual que los 28 serotipos de Echovirus (E1 a E33, excepto 8, 10, 22, 23 y 28), se consideran serotipos de la especie Enterovirus humano B. De igual forma, algunos de los serotipos anteriores de Enterovirus (EV-A71, y otros) se consideran serotipos de la especie Enterovirus humano A, mientras que otros serotipos se consideran incluidos en la especie Enterovirus humano B, otros en la especie Enterovirus humano C, otros en la especie Enterovirus humano, D y otros en la especie J. De la misma forma los más de 100 serotipos de Rhinovirus han sido distribuidos en tres especies (Rhinovirus A, B y C). Actualmente, su número se ha incrementado mucho y continúan describiéndose especies que no pertenecen a ninguno de los géneros admitidos hasta ahora (por ejemplo Kosavirus, Cosavirus, Parechovirus, …).

            A continuación exponemos los distintos géneros y especies de la familia Picornaviridae (Picornavirus), que incluyen a virus patógenos humanos.

Género Enterovirus

Enterovirus A (antes Human enterovirus A):

23 tipos: coxsackievirus A2 (CV-A2), CV-A3, CV-A4, CV-A5, CV-A6, CV-A7, CV-A8, CV-A10, CV-A12, CV-A14, CV-A16, enterovirus (EV) A71, EV-A76, EV-A89, EV-A90, EV-A91, EV-A92, EV-114, EV-A119, SV19, SV43, SV46 y BA13.

Enterovirus B (antes Human enterovirus B):

60 tipos: coxsackievirus B1 (CV-B1), CV-B2, CV-B3, CV-B4, CV-B5 (incl. swine vesicular disease virus [SVDV]), CV-B6, CV-A9, echovirus 1 (E-1; incl. E-8), E-2, E-3, E-4, E-5, E-6, E-7, E-8 (actualmente E-1), E-9 (incl. CV-A23), E-11, E-12, E-13, E-14, E-15, E-16, E-17, E-18, E-19, E-20, E-21, E-24, E-25, E-26, E-27, E-28 (actualmente Rhinovirus A1), E-29, E-30, E-31, E-32, E-33, enterovirus B69 (EV-B69), EV-B73, EV-B74, EV-B75, EV-B77, EV-B78, EV-B79, EV-B80, EV-B81, EV-B82, EV-B83, EV-B84, EV-B85, EV-B86, EV-B87, EV-B88, EV-B93, EV-B97, EV-B98, EV-B100, EV-B101, EV-B106, EV-B107, EV-B110 y SA5.

Enterovirus C (antes Human enterovirus C):

23 tipos: poliovirus (PV) 1, PV-2, PV-3, coxsackievirus A1 (CV-A1), CV-A11, CV-A13, CV-A17, CV-A19, CV-A20, CV-A21, CV-A22, CV-A24, EV-C95, EV-C96, EV-C99, EV-C102, EV-C104, EV-C105, EV-C109, EV-C113, EV-C116, EV-C117 y EV-118.

Enterovirus D (antes Human enterovirus D):

5 tipos: enterovirus D68 (EV-D68), EV-D70, EV-D94, EV-D111 y EV-D120.

Enterovirus E (antes Bovine enterovirus grupo A):

4 tipos (propuestos): enterovirus E1 (EV-E1), EV-E2, EV-E3 y EV-E4.

Enterovirus F (antes Bovine enterovirus grupo B):

6 tipos (propuestos): enterovirus F1 (EV-F1), EV-F2, EV-F3, EV-F4, EV-F5 y EV-E6.

Enterovirus G (antes Porcine enterovirus B):

6 tipos: enterovirus (EV) G1 to G6 (antes porcine enterovirus 9–10, 14–16 y ovine enterovirus 1).

Enterovirus H (antes Simian enterovirus A):

1 tipo: enterovirus H1 (EV-H1).

Enterovirus J:

6 tipos: simian virus 6 (SV6), enterovirus J103 (EV-J103), EV-J108, EV-J112, EV-J115 y EV-J121.

Rhinovirus A (antes Human rhinovirus A):

77 tipos: human rhinovirus (HRV) A1 (antes Echovirus 28), A2, A7, A8, A9, A10, A11, A12, A13, A15, A16, A18, A19, A20, A21, A22, A23, A24, A25, A28, A29, A30, A31, A32, A33, A34, A36, A38, A39, A40, A41, A43, A44, A45, A46, A47, A49, A50, A51, A53, A54, A55, A56, A57, A58, A59, A60, A61, A62, A63, A64, A65, A66, A67, A68, A71, A73, A74, A75, A76, A77, A78, A80, A81, A82, A85, A88, A89, A90, A94, A95, A96, A98, A100, A101, A102 y A103.

Rhinovirus B (antes Human rhinovirus B):

25 tipos: human rhinovirus (HRV) B3, B4, B5, B6, B14, B17, B26, B27, B35, B37, B42, B48, B52, B69, B70, B72, B79, B83, B84, B86, B91, B92, B93, B97 y B99.

Rhinovirus C (antes Human rhinovirus C):

51 tipos: human rhinovirus (HRV) C1–C51.

Género Hepatovirus

Hepatitis A virus

1 tipo: hepatitis A virus (HAV) 1.

Género Kobuvirus

Aichivirus A (antes Aichi virus)

3 tipos: Aichi virus (AiV) 1, canine kobuvirus 1 (CaKV-1) y murine kobuvirus 1 (MuKV-1).

Aichivirus B (antes Bovine kobuvirus) (Kobuvirus bovino)

2 tipos: bovine kobuvirus (BKV) 1 y ovine kobuvirus 1 (OKV-1).

Aichivirus C

1 tipo: porcine kobuvirus 1 (PKV-1).

Género Parechovirus

Human parechovirus (Parechovirus humanos)

14 tipos: human parechovirus (HPeV) 1-14.

Ljungan virus

4 tipos: Ljungan virus (LV) 1–4.

Género Aphthovirus

Foot-y-mouth disease virus (glosopeda)

7 tipos: O, A, C, Southern African Territories (SAT) 1, SAT 2, SAT 3 y Asia 1.

Género Cardiovirus

Encephalomyocarditis virus (virus de la encefalomiocarditis)

2 tipos: encephalomyocarditis virus (EMCV) 1 y EMCV-2. Nota: Columbia SK virus, Maus Elberfeld virus y Mengovirus son cepas de EMCV-1.

Theilovirus

12 tipos: Theiler's murine encephalomyelitis virus (TMEV), Vilyuisk human encephalomyelitis virus (VHEV), Thera virus (TRV), Saffold virus (SAFV) 1–9.

Género Cosavirus

Cosavirus A

24 tipos: cosavirus A1 (CoSV-A1) a CoSV-A24.

Principales enfermedades causadas por Enterovirus:

  • Enfermedad febril inespecífica: es la enfermedad más común provocada por la infección por Enterovirus. Además de fiebre, los pacientes manifiestan dolor muscular, faringitis, alteración gastrointestinal, cefaleas y molestias abdominales.
  • Meningitis aséptica: los Enterovirus son la principal causa de meningitis aséptica en niños.
  • Enfermedad de Bornholm o pleurodinia epidémica: caracterizada por dolor intenso torácico y abdominal, junto con fiebre, y a veces nauseas, cefaleas y vómitos.
  • Pericarditis y/o myocarditis: fiebre, con disnea y dolor torácico. Puede aparecer arritmia, fracaso cardiaco e infarto de miocardio.
  • Conjuntivitis hemorrágica aguda.
  • Herpangina: exantema vescular en cavidad oral y faringe, junto con fiebre, faringitis, malestar, y con frecuencia disfagia, pérdida de apetito, dolor de espalda, y cefaleas. ES un proceso autolimitado de unos 3 a 4 días de duración (Coxsackie A).
  • Glosopeda (enfermedad mano, pie y boca) (Coxsackie A virus o EV71).
  • Encefalitis: es raro que sea provocada por Enterovirus. Cuando ocurre, suele ser por echovirus 9.
  • Hepatitis A (Hepatovius: virus de hepatitis A; 1 tipo).
  • Poliomielitis (Enterovirus C: Poliovirus –PV- 1, 2 ó 3).
  • Síndrome de fatiga crónica: se ha descrito asociado a infecciones agudas o gastrointestinales asociadas con Enterovirus.
  • Diabetes mellitus tipe 1: se ha descrito que Enterovirus podría penetrar en páncreas y el sistema inmunitario destruir las células beta productoras de insulina cuando tratan de eliminar Enterovirus.

Procesos causados por Hepatovirus (virus de hepatitis A)

  • Hepatitis vírica A.

Procesos causados por Kobuvirus (virus Aichi – Aichivirus, 3 serotipos)

  • Gastroenteritis por Aichivirus serotipo 1 (AiV1).

Procesos causados por Parechovirus (Human Parechovirus, 14 serotipos, HPeV 1-14)

  • Gastroenteritis leves.
  • Infecciones respiratorias leves.

Procesos causados por Cosavirus (24 serotipos)

  • Gastroenteritis diarreica.

Procesos causados por Cardiovirus (Encephalomyocarditis virus, 2 tipos – EMCV 1 & 2; Theilovirus, 12 tipos)

  • Encephalomiocarditis (EMC 1 & 2).
  • Vilyuisk encephalomyelitis virus (Theilovirus): encefalitis de Vilyuisk.
  •  Saffold virus (SAFV) (Theilovirus): encontrado en heces, pero sin reconocimiento patógeno).

Transmisión de Picornaviridae (Picornavirus)

            Contacto directo persona a persona por secreciones respiratorias, conjuntivales, ….

            Vía feco-oral a través de agua contaminada o de alimentos contaminados.

            Contacto indirecto a través de objetos contaminados.

Pruebas realizadas en IVAMI:

            En IVAMI podemos realizar el aislamiento de aquellos que son cultivables en las líneas celulares habituales. No obstante, al no poderse cultivar algunos de ellos en las líneas celulares habituales, recomendamos el diagnóstico molecular, realizado mediante una RT-PCR, de genes conservados, y posteriormente la secuenciación del amplicón obtenido para poder definir la especie Enterovirus A a D; Rhinovirus A, B o C; y el tipo de virus causal.

Muestras recomendadas:

            La/s muestra/s depende/n de la patología padecida por el paciente.

  • Gastroenteritis: heces emitidas o muestra rectal, tras atravesar esfínter anal, tomada con torunda de dacrón.
  • Meningitis o encefalitis: líquido cefalorraquídeo obtenido por punción.
  • Infecciones respiratorias: exudado faríngeo o nasofaríngeo con torunda de dacrón.
  • Enfermedad febril inespecífica: exudado faríngeo, o mejor nasofaríngeo, tomado con torunda de dacrón.
  • Herpangina: exudado de lesiones orales tomado con torunda de dacrón.
  • Poliomielitis o síndrome Poliomielitis-like: líquido cefalorraquídeo tomado por punción.
  • Conjuntivitis hemorrágica: exudado conjuntival tomado con torunda de dacrón
  • Pericarditis o miocarditis: líquido pericárdico obtenido por punción.
  • Resfriado con rinitis: exudado nasal tomado con torunda de dacrón.
  • Glosopeda: exudado de lesiones orales tomado con torunda de dacrón.

Tipo de envase: estéril, adecuado al tipo de muestras.

Conservación y envío de la muestra:

 

  • Refrigerada (preferido) durante menos de 2 días.
  • Congelada más de 48 horas.

Envío al laboratorio:

 

  • Refrigeradas.

 

Plazo de entrega:

 

  • RT-PCR: 48 horas.
  • Identificación molecular: 72 a 96 horas.

 

Coste de las pruebas: