Ajos y otras especie de Allium, Virus de ..., (ajos, cebollas, puerros, chalotas) - Detección molecular (RT-PCR) e identificación (secuenciación).

Existen varias especies de virus que pueden afectar a las especies de Allium (ajos, cebollas, puerros, chalotas). La infección de las plantas por estos virus tiene una repercusión importante para la producción de bulbos que se reduce considerablemente (hasta 50 a 88%) a pesar de que la infección no mate a la planta.

La infección puede ocurrir por mas de 8 virus diferentes, que pueden provocar la infección de forma asociada formando un complejo viral (Garlic viral complex, Complejo viral del ajo) que provoca la enfermedad llamada “mosaico de los ajos” (Garlic mosaic), en el que participarían dos o más virus de los géneros Potyvirus,  Carlavirus y/o Allexivirus. Esta enfermedad se caracteriza por el rayado amarillo, manchas cloróticas difusas, hojas retorcidas y mosaicos.

Todos estos virus tienen un genoma de ARN y pertenecen a tres géneros diferentes: Potyvirus, Carlavirus y Allexivirus. Las especies de estos virus son:

Genero Potyvirus:

  • OYDV: Onion Yellow Dwarf virus (virus de la cebolla pequeña amarilla).
  • LYSV: Leek Yellow Stripe virus (virus de puerro amarillo rayado).
  • SYSV: Shallot Yellow Stripe virus (virus de la chalota amarilla rayada).
  • WoYSV: Welsh Onion Yellow Stripe virus (virus de la cebolla Welsh amarilla rayada).

Genero Carlavirus:

  • GCLV / GarCLV: Garlic Common Latent virus (virus latente común del ajo).
  • SLV : Shallot Latent virus (virus latente de la chalota). Este virus se considera igual o al menos relacionados antigénicamente, y que diferiría en su termoinactivación.

Genero Allexivirus:

  • GVX: Garlic virus X (virus X de ajos).
  • ShVX: Shallot virus X (virus X de la chalota).
  • Garlic Mite Borne Filamentous virus (virus filamentoso de ajo transmitido por ácaros).

Métodos de diagnostico recomendados

Se han utilizado métodos para detectar antígenos de estos vírus como los métodos inmunoenzimáticos de varias formas de diseño (ELISA, Dot ELISA, Blotting Immunoassay), pero todos en general tropiezan con dos problemas: sensibilidad limitada, y dificultad para disponer de anticuerpos específicos para detectar cada uno de estos vírus).

Por esas razones actualmente se están imponiendo los métodos moleculares de RT- PCR que incrementan la sensibilidad y rapidez.

Pruebas realizadas en IVAMI

  • RT-PCR para cada uno de los virus citados.

Muestras recomendadas

  • Hojas de plantas con síntomas de mosaico.

Conservación y envío de muestras:

  • Menos de 48 horas: introducidas en envase de plástico estéril, y a ser posibles refrigeradas (contenedor de poliestireno –corcho blanco-, con pack –frigolines- congelados).
  • Más de 48 horas: congeladas.

Entrega de resultados:

  • Métodos moleculares: 48 a 72 horas. 

Coste de la prueba: