Microbiología clínica
- Formulario para petición de pruebas de Microbiología clínica.
- Toma de muestras para pruebas microbiológicas.
- Acanthamoeba spp. - Queratitis amebiana (AK: Amebic Keratitis) y Encefalitis amebiana granulomatosa (GAE: Granulomatous Amebic Encephalitis): Examen microscópico; Aislamiento en cultivo; Diagnóstico molecular (Real-time PCR); Identificación
- Acanthocheilonema reconditum - Diagnóstico molecular (PCR).
- Ácaros parásitos humanos (ver Demodex folliculorum y/o Sarcoptes scabiei).
- Achromobacter spp. y Achromobacter xylosoxidans: Diagnóstico molecular (PCR); Identificación molecular de especie (secuenciación)..
- Actinobacillus pleuropneumoniae - Diagnóstico molecular (PCR).
- Actinomyces israelii - Diagnóstico molecular (PCR).
- Actinomyces naeslundii - Diagnóstico molecular (PCR).
- Actinomyces spp.: Diagnóstico molecular (PCR); Identificación molecular de especie (secuenciación).
- Actinomyces viscosus - Diagnóstico molecular (PCR).
- Actopobium spp.: Diagnóstico molecular (PCR); Identificación molecular de especie (secuenciación).
- Adenovirus entéricos (serotipos 40 y 41) - Antígeno en heces.
- Adenovirus, Influenza, Parainfluenza y Virus respiratorio sincitial (VRS) - (Ver virus respiratorios).
- Adenovirus respiratorios: Aislamiento en cultivo celular; Anticuerpos IgM e IgG (ELISA); Diagnóstico molecular (rt-PCR); Identificación de especie (A a B) (secuenciación); Identificación de tipo (secuenciación).
- Aeromonas spp. - Patógenos emergentes asociados con enfermedades gastrointestinales y extraintestinales: Aislamiento en cultivo; Diagnóstico molecular (PCR); Identificación molecular de especie (secuenciación).
- Aglutinaciones - Brucella spp. (Ver Brucella spp.; Salmonella spp.
- Aichivirus - (Ver Picornaviridae-Picornavirus).
- Alicyclobacillus spp.: Aislamiento en cultivo; Diagnóstico molecular (PCR); Identificación molecular de especies (secuenciación).
- Alphavirus (Arbovirus, Togaviridae): Diagnóstico molecular de Alphavirus (RT-PCR); Identificación molecular de especies (secuenciación).
- Amebas de vida libre (Ver Acanthamoeba spp. y Naegleria spp.).
- Amebiasis - (Ver Entamoeba histolytica).
- Aminoglucósidos, resistencia (genes aac(3)-I; aac(3)-II; aac(3)-II/VI; aac(6´)-Ib; aac(6´)-II; aac(6)-II/Ib; ant(2´´)-Ia; ant(3´´)-Ia; aph(3´)-IIa; aph(3´)-VI; rmtA(3); rmtB; rmtC; rmtD; arm; nmpA
- Anaerobios obligados (estrictos): aislamiento en cultivo (ver: Cultivos).
- Anaplasma phagocytophilum (Previamente Ehrlichia phagocytophila - Anaplasmosis humana (Human granulocytic anaplasmosis; Tick-borne fever; Pasture fever) - Examen microscópico; Diagnóstico molecular (PCR).
- Ancylostoma spp. (A. caninum, A. braziliensis, A. ceylanicum, A. duodenales, A. tubaeforme) (Necator americanus): Diagnóstico molecular (PCR); Identificación molecular de especie (secuenciación).
- AnellovirusII (Torque Teno virus –TTV-, Torque Teno Midi virus TTMDV-, y Torque Teno Mini virus –TTMV-) - Diagnóstico molecular (PCR); Identificación (secuenciación).
- Angiostrongylus cantonensis, Angiostrongylus vasorum: Diagnóstico molecular (PCR).
- Anisakis spp. - Examen macroscópico y microscópico; Identificación molecular de especie (secuenciación).
- Anquilostomiasis y uninariasis - (Ver Ancylostoma spp.- Necator americanus).
- Antibiograma de bacterias habituales y especiales - Disco-placa; CMI por dilución en agar; CMI por microdilución.
- Antibióticos - Determinación de la potencia de un antibiótico: Método turbidimétrico (tubo) o método de difusión (cilindro-placa o placa), según USP (United States Pharmacopeia).
- Anticuerpos heterófilos (mononucleosis) - (Ver Epstein Barr, Virus de ...,).
- Antifungigrama - (Ver Hongos).
- Antígeno Galactomanano: (ver Aspergillus spp.).
- Antígeno manano: (ver Candida spp.).
- Antígenos bacterianos capsulares: Haemophilus influenzae, Streptococcus pneumoniae, Streptococcus grupo B y Neisseria meningitidis (A, B, C, W, Y).
- Antimicrobianos - Resistencia fenotípica y genotípica (cualquier bacteria y cualquier antibiótico).
- Aphthovirus - (Ver Picornaviridae-Picornavirus).
- Arañazo de gato - (Ver Bartonella henselae).
- Arbovirus (Arthropod Borne virus):Diagnóstico molecular (RT-PCR y secuenciación); Anticuerpos tipo específicos (neutralización) para virus Chikungunya, Mayaro, Zika y West Nile (otros consultar).
- Arcanobacterium haemolyticum (antes Corynebacterium haemolyticum): Cultivo; Diagnóstico molecular (PCR).
- Arcobacter spp. - Interés en patología humana y animal y en fuentes de contaminación (aguas o alimentos de origen animal): cultivo e identificación molecular (PCR y secuenciación).
- Arenavirus: (ver Coriomeningitis linfocitaria, virus de la ...-LCMV-).
- Artritis bacteriana - Etiología: Cultivo; Diagnóstico molecular (PCR y secuenciación).
- Artrópodos: Identificación molecular (secuenciación).
- Ascaris lumbricoides - Examen microscópico para huevos en heces; Anticuerpos IgG.
- Aspergillus spp. (A. fumigatus, A. flavus, A. terreus, A. glaucus): Antígeno galactomanano; Aislamiento en cultivo; Diagnóstico molecular (PCR); Identificación molecular de especie (secuenciación); Tipado genético comparativo (microsa
- Astrovirus - Diagnóstico molecular (RT-PCR).
- Atopobium vaginae: Diagnóstico molecular (PCR).
- Aura, Virus ..., (Ver Alphavirus, Togaviridae).
- Babauki, Virus ..., (Alphavirus, Togaviridae) - (Ver Arbovirus).
- Babesia spp.(Babesia microti, B. bovis, B. divergens): Examen microscópico; Diagnóstico molecular (PCR); Identificación molecular de especie (secuenciación).
- Bacillus anthracis: Aislamiento en cultivo; Identificación molecular (secuenciación).
- Bacillus cereus: Aislamiento en cultivo; Identificación molecular (secuenciación); Diagnóstico molecular de genes de toxinas (toxina emética-cerulide (gen ces); citotoxina K (gen cytK), enterotoxina hemolítica HBL (gen hblc); enterotoxina F
- Bacillus claussi: Aislamiento en cultivo; Identificación molecular (secuenciación); Diagnóstico molecular (PCR).
- Bacillus subtilis (grupo de especies Bacillus subtilis): Aislamiento en cultivo; identificación molecular (secuenciación); Detección de toxinas.
- Bacilos ácido-alcohol resistentes (BAAR) - (Ver Micobacterias).
- Bacterias aerobias: Aislamiento en cultivo aerobio; Identificación molecular (secuenciación); Pruebas de sensibilidad a los antimicrobianos.
- Bacterias anaerobias estrictas (obligadas): Aislamiento en cultivo anaeróbico; Identificación molecular (secuenciación); Pruebas de sensibilidad a los antimicrobianos.
- Bacterias, sin especificar: Aislamiento en cultivo aerobio y anaerobio; Identificación molecular (secuenciación); Pruebas de sensibilidad a los antimicrobianos.
- Bacteroides fragilis: Diagnóstico molecular de producción enterotoxina (PCR).
- Balamuthia mandrillaris (Encefalitis amebiana granulomatosa): Diagnóstico molecular (PCR).
- Barmah, Virus del bosque de ..., (BFV: Barmah Forest virus) (Alphavirus, Togaviridae) - (Ver Arbovirus).
- Bartonella henselae - Anticuerpos IgG; Anticuerpos IgM; Diagnóstico molecular (PCR).
- Bartonella quintana: Anticuerpos IgM e IgG; Diagnóstico molecular (PCR).
- Bartonella spp. (B. henselae, B. quintana, B. clarridgiae, B. elisabethae, B. vinsonii, B. bacilliformis): Diagnóstico molecular (PCR tiempo-real; Identificación molecular de especie (secuenciación).
- Bebaru, virus ...: ver Alphavirus, Togaviridae.
- Beta-lactamasas (Cromosómicas AmpC, espectro extendido BLEEs, Carbapenemasas clases A, B, C y D, metalobetalactamasas) - Detección molecular (PCR) y tipado de beta-lactamasa (secuenciación).
- BK virus (Polyomavirus): Aislamiento en cultivo celular; Diagnóstico molecular (PCR).
- Blastocystis spp., Blastocystis hominis: Examen microscópico; Cultivo; Detección molecular (PCR); Identificación de subtipos (PCR y secuenciación).
- Blastomyces dermatitidis: Aislamiento en cultivo; Diagnóstico molecular (PCR).
- Bocavirus: Bocavirus: Diagnóstico molecular (rt-PCR).
- Bordetella holmesii: Diagnóstico molecular (PCR).
- Bordetella parapertussis: Anticuerpos IgM e IgG; Diagnóstico molecular (PCR).
- Bordetella pertussis: Anticuerpos IgA, IgM e IgG; Diagnóstico molecular (PCR).
- Bornavirus – Virus neurotrópicos con interés en patología humana y animal: Diagnóstico molecular (PCR).
- Borrelia burgdorferi sensu stricto y B. burgdorferi sensu lato (Enfermedad de Lyme): Anticuerpos IgM e IgG; Diagnóstico molecular (PCR); Identificación molecular (secuenciación).
- Borrelia recurrentis productora de fiebre recurrente epidémica - Diagnóstico molecular (PCR).
- Borrelia spp. productora de fiebre recurrente endémica (B.duttoni, B.hispanica, B.hermsi, B.parkeri, B.venezualensis, B.persica, B.turicatae, B.caucasica, B.mazzoti, B.crucidarae, ..)-Diagnóstico molecular (PCR y secuenciación)
- Bosque de Kyasanur, Virus de la enfermedad del ..., (KFDV: Kyasanur Forest Disease virus) (Flavirivirus, Flaviviridae) - (Ver Arbovirus).
- Bosque de Semliki, Virus del ..., (SFV: Semliki Forest virus) (Alphavirus, Togaviridae) - (Ver Arbovirus).
- Botulismo - (Ver Clostridium botulinum en el Área de pruebas de Clostridium botulinum)
- Brachyspira spp. - Espiroquetosis intestinal humana: Diagnóstico molecular (PCR).
- Brucella - Cultivo, anticuerpos IgM e IgG; anticuerpos completos e incompletos; Anticuerpos IgG; Anticuerpos totales; Anticuerpos totales (Rosa Bengala); Prueba de Coombs; Diagnóstico molecular (PCR).
- Brugia malayi - (Ver Filarias - Filariasis).
- Brugia timori - (Ver Filarias - Filariasis).
- Buggy Creek, Virus ..., (Alphavirus, Togaviridae) (Ver Arbovirus).
- Burkholderia cepacia complex: Patógenos oportunistas en pacientes con fibrosis quística: Cultivo; Diagnóstico molecular (PCR); Identificación de especie (PCR y secuenciación).
- Burkholderia pseudomallei (Melioidosis)- Cultivo y diagnóstico molecular (PCR).
- Calicivirus (Norwalk y virus relacionados) - Diagnóstico molecular (RT-PCR); Identificación (secuenciación).
- Campylobacter jejuni, C. laridis, C. coli - Cultivo; Diagnóstico molecular (PCR).
- Campylobacter rectus - Diagnóstico molecular (PCR).
- Candida - Antígeno (manano), Detección de...; Anticuerpos; Diagnóstico molecular (PCR).
- Candida spp. - Genotipado: Determinación de genotipo (A, B, C, D o E); secuencias ALT en región genómica RPS; Presencia de microsatélites; MLST (Multilocus Sequencing Typing).
- Capillaria philippinensis: Examen microscópico e identificación molecular (secuenciación); Diagnóstico molecular (PCR).
- Carbapenemasas clase A, B, C y D - (Ver Beta-lactamasas).
- Cardiovirus - (ver Picornaviridae - Picornavirus).
- Cervicitis (Neisseria gonorrhoeae, Chlamydia trachomatis, Virus Herpes simple tipos 1 y 2): Diagnóstico molecular (PCR).
- Chagas´, Enfermedad de …, - (Ver Trypanosoma cruzi).
- Chikungunya, Virus ..., (Alphavirus, Togaviridae) (Arbovirus) - Anticuerpos IgM; Anticuerpos IgG; Anticuerpos tipo específicos por neutralización; Diagnóstico molecular (RT-PCR y secuenciación).
- Chlamydia trachomatis - Cultivo; Anticuerpos IgA; Anticuerpos IgM; Anticuerpos IgG; Anticuerpos totales; Diagnóstico molecular (PCR); Identificación molecular de serotipos (PCR y secuenciación).
- Chlamydophila pneumoniae - Cultivo; Anticuerpos IgA; Anticuerpos IgM; Anticuerpos IgG; Seroconversión de anticuerpos; Anticuerpos totales; Diagnóstico molecular (PCR).
- Chlamydophila psittaci - Anticuerpos IgM, IgG y totales; Diagnóstico molecular (PCR y secuenciación).
- Cisticercosis - (Ver Taenia solium).
- Citomegalovirus - Antigenemia; Antígeno pp65; Cultivo (Shell-vial); Anticuerpos IgM e IgG (ELISA), Diagnóstico molecular (PCR); Carga vírica; Mutaciones de resistencia (PCR y secuenciación).
- Cladosporium spp. - Diagnóstico molecular (PCR).
- Clostridium botulinum - Cultivos; Detección de toxina; Detección de antitoxina A, B y C; Detección molecular de genes de toxinas por PCR; Carga bacteriana por PCR Real-Time (Ver Área específica de Clostridium botulinum.
- Clostridium botulinum: Detección de anticuerpos anti-toxina botulínica en suero o plasma, mediante prueba de referencia de neutralización en ratones.
- Clostridium difficile - Cultivo; detección de citotoxina en cultivo celular; genes de toxinas A, B y binaria por PCR; deleciones en gen tcdC (cepas hipervirulentas); ribotipado (cepas hipervirulentas NAP1/BI/027 y otras).
- Clostridium perfringens - Cultivo; Detección e identificación molecular (PCR y secuenciación); Detección de genes productores de enterotoxinas y fosfolipasa (PCR).
- Clostridium tetani - Detección de toxina (inoculación experimental y prueba de neutralización); Anticuerpos IgG; Diagnóstico molecular (PCR y secuenciación).
- CMV - (Ver Citomegalovirus).
- Coccidioides immitis - Diagnóstico molecular (PCR).
- Comparación de microorganismos - Comparación molecular de bacterias y hongos usando 6 a 8 loci.
- Coombs - (Ver Brucella).
- Coprocultivo - (ver Cultivos de heces).
- Corinebacterias - (ver Corynebacterium).
- Coriomeningitis linfocitaria, Virus de ..., - Diagnóstico molecular (RT-PCR).
- Coronavirus MERS (Middle East Respiratory Syndrome) - Diagnóstico molecular (RT-PCR y secuenciación).
- Coronavirus respiratorios - Diagnóstico molecular (RT-PCR).
- Coronavirus SARS-CoV-2 (COVID-19; 2019nCoV; Wuhan Coronavirus): Diagnóstico molecular (RT-PCR en tiempo real).
- Coronavirus SARS-CoV-2 (Coronavirus de COVID-19): Anticuerpos neutralizantes protectores, específicos frente a SARS-CoV-2 (COVID-19).
- Corynebacterium diphtheriae - Cultivos; Detección de cepas toxigénicas; Anticuerpos IgG (ELISA); Anticuerpos antitoxina (neutralización en cobaya); Diagnóstico molecular (PCR).
- Corynebacterium spp. (C. jeikeium, C. urealyticum, C. striatum, C. pseudotuberculosis, C. pyogenes, C. pseudodiphtheriticum, etc...,) - Cultivo; Sensibilidad antimicrobiana; Diagnóstico molecular (PCR).
- Cosavirus - (ver Picornaviridae - Picornavirus).
- Cowpox virus (CPXV) - (Ver Poxvirus de origen animal).
- Coxiella burnetii (Fiebre Q) - Anticuerpos IgM, IgA, IgG y totales (ELISA); Anticuerpos de fases I y II (inmunofluorescencia); Diagnóstico molecular (PCR).
- Coxsackie A (actualmente tipos de la especie Enterovirus A o de especie Enterovirus B) - (Ver Picornaviridae - Picornavirus).
- Coxsackie B (actualmente tipos de la especie Enterovirus B) - (Ver Picornaviridae - Picornavirus).
- Coxsackie virus (actualmente tipos de Enterovirus) - (Ver Picornaviridae - Picornavirus).
- Cryptococcus neoformans - Exámen microscópico; Antígeno (cualitativo); Antígeno (cuantificación); Cultivo; Diagnóstico molecular (PCR).
- Cryptosporidium - Examen microscópico; Antígeno en heces; Diagnóstico molecular (PCR).
- Cultivos - Cualquier tipo de cultivo para bacterias, hongos, virus o protozoos que puedan desarrollarse en cultivos.
- Cyclospora cayetanensis. Diagnóstico molecular (PCR).(Ver Cyclospora cayetanensis en Área de Microbiología vegetal).
- Dengue, Virus del ..., (serotipos 1 a 4) - Anticuerpos IgM e IgG; Diagnóstico molecular (RT-PCR); Identificación de serotipos (PCR y secuenciación).
- Dermatofitos - (Ver Hongos Dermatofitos).
- Diagnóstico molecular (PCR, RT-PCR, PCR Real Time) - (Ver cada microorganismo).
- Dientamoeba fragilis - Diagnóstico molecular (PCR).
- Diphyllobothrium spp. (difilobotriasis). Patogenia y especies: diagnóstico parasitológico e identificación molecular de especies.
- Dirofilaria immitis - (ver Filarias - Filariasis).
- Dirofilaria repens - (Ver Filarias - Filariasis).
- Distomatosis hepática - (Ver Fasciola hepatica).
- Distomatosis - (ver Fasciola hepatica).
- Donovanosis / Granuloma inguinal - Klebsiella granulomatis (antes Calymmatobacterium granulomatis): Diagnóstico molecular (PCR).
- Ebola, Virus ..., - Diagnóstico molecular (RT-PCR y secuenciación).
- EBV - (Ver: Epstein Barr virus).
- Echinococcus granulosus - Anticuerpos IgG; Diagnóstico molecular (PCR).
- Echinococcus multilocularis (Hidatidosis alveolar) - Diagnóstico molecular (PCR).
- Echovirus (actualmente tipos de la especie Enterovirus B) - (Ver Picornaviridae - Picornavirus).
- Ehrlichia spp.: Ehrlichia ewingii (Ehrliquiosis granulocítica), Ehrlichia phagocytophila (Ehrliquiosis granulocítica) y Ehrlichia chaffeensis (Ehrliquiosis monocítica) - Examen microscópico; Diagnóstico molecular (PCR).
- Encefalitis de California, Virus de la ..., (Bunyavirus, Bunyaviridae) - (Ver Arbovirus).
- Encefalitis de Powasan, Virus de la ..., (PEV: Powasan Encephalitis virus) (Flavirivirus, Flaviviridae) - (Ver Arbovirus).
- Encefalitis de Saint Louis, Virus de la ..., (SLEV: Saint Louis Encephalitis virus) (Flavirivirus, Flaviviridae) - (Ver Arbovirus).
- Encefalitis del valle de Murray, Virus de la ..., (MUEV: Murray Valley Encephalitis virus) (Flavirivirus, Flaviviridae) - (Ver Arbovirus).
- Encefalitis equina del Este, Virus de la ..., (EEEV: Eastern Equine Encephalitis virus) (Alphavirus, Togaviridae) - (Ver Arbovirus).
- Encefalitis equina del Oeste, Virus de la ..., (WEEV: Western Equine Encephalitis virus) (Alphavirus, Togaviridae) - (Ver Arbovirus).
- Encefalitis equina venezolana, virus de la ..., (VEEV: Venezuelan Equine Encephalitis virus) (Alphavirus, Togaviridae) - (Ver Arbovirus).
- Encefalitis japonesa, Virus de la ..., (JEV: Japanesse Encephalitis virus) (Flavirivirus, Flaviviridae) - (Ver Arbovirus).
- Encefalitis por garrapatas, Virus de la ..., (TBEV: Tick-borne Encephalitis virus) (Flavirivirus, Flaviviridae) - (Ver Arbovirus).
- Encefalitozoonosis - (Ver Microsporidium - Microsporidia).
- Encefalomiocarditis virus (ver Picornaviridae - Picornavirus) - (Ver Arbovirus).
- Encephalitozoon cuniculi, Encephalitozoon hellen, Encephalitozoon intestinalis (Ver Encephalitozoon cuniculi en Área de Microbiología Veterinaria Molecular).
- Encephalocytozoon cuniculi, Encephalitozoon intestinalis y Enterocytozoon bieneusi (ver Microsporidium - Microsporidia).
- Endotoxinas - Prueba cromogénica cuantitativa LAL (Limulus Amebocyte Lysate).
- Enfermedad de Lyme - (Ver Borrelia burgdorferi sensu stricto y Borrelia burgdorferi sensu lato).
- Enfermedad pélvica inflamatoria.
- Enfermedades/Infecciones de transmisión sexual: Diagnóstico molecular (PCR) individual o según presentación sindrómica clínica.
- Entamoeba dispar - (ver Entamoeba histolytica, Entamoeba dispar y Entamoeba moshkovskii).
- Entamoeba histolytica, Entamoeba dispar y Entamoeba moshkovskii - Anticuerpos IgG; Diagnóstico molecular (PCR); Identificación de especie (PCR y secuenciación).
- Enterobius vermicularis - Examen microscópico y diagnóstico molecular (PCR).
-
Enterocytozoon bieneusi (Microsporidiosis) - (Ver
en Área de Microbiología Veterinaria Molecular). - Enterocytozoon bieneusi (ver Microsporidium - Microsporidia).
- Enterovirus (actualmente tipos de las especies de Enterovirus A, B, D o J) - (Ver Picornaviridae-Picornavirus).
- Eosinofilia pulmonar tropical – Anticuerpos IgG frente a filarias; Anticuerpos IgG para diagnóstico diferencial con Schistosoma spp., Strongyloides stercoralis, Ascaris lumbricoides, Toxocara spp. y Basiodiobolus ranarum.
- Epididimitis (Neisseria gonorrhoeae, Chlamydia trachomatis): Detección molecular (PCR).
- Epstein Barr, virus de - Anticuerpos anti-EA IgG e IgM; Anticuerpos anti EBNA IgG, IgM; Anticuerpos anti-VCA IgG, IgM; Anticuerpos heterófilos; Avidez de anticuerpos IgG frente a VCA; Diagnóstico molecular (PCR); Carga viral; Tipos 1 y 2.
- Erisipeloide de Baker-Rosenbach - (Ver Erysipelothrix rhusiopathiae).
- Erysipelothrix rhusiopathiae (Erisipeloide de Baker-Rosenbach; Erisipela del cerdo; Mal rojo del cerdo): Cultivo; Diagnóstico molecular (PCR)
- Erythrovirus B19 - (Ver Parvovirus B19).
- Escherichia coli enteroagregativo (EAggEC, EAEC) - Diagnóstico molecular (PCR).
- Escherichia coli enterohemorrágico (O157:H7 y otros) - Cultivo en medios diferenciales; Diagnóstico molecular (genes stx1 y stx2).
- Escherichia coli enteroinvasivo - Cultivo; Invasión celular; Diagnóstico molecular (PCR).
- Escherichia coli enterotoxigénico - Diagnóstico molecular de toxinas termolábil y termoestable (PCR).
- Escherichia colik1 - Diagnóstico molecular (PCR).
- Escherichia coli: Mutaciones de resistencia a los antimicrobianos (β-lactámicos, quinolonas, TMP-SMX, cloranfenicol, tetraciclinas).
- Escherichia coli - Principales virotipos enteropatogénicos (ETEC, EPEC, EaggEC-EAEC, EIEC, EHEC y DAEC; Escherichia coli K1: diagnóstico molecular (PCR).
- Escherichia coli productora de shigatoxina (STEC) - Determinación del serogrupo: Identificación molecular (PCR).
- Escherichia coli productora de shigatoxina (STEC) - Determinación del serogrupo-O y del serotipo H: Identificación molecular (PCR).
- Esporotricosis - (Ver Sporothrix schenckii).
- Esquistosomiasis (Schistosoma spp. - Anticuerpos IgG; Diagnóstico molecular (PCR); Identificación molecular de especie (PCR y secuenciación).
- Estomatitis Pustulosa Bovina, virus de ..., (BPSV) - (Ver Poxvirus de origen animal).
- Estreptococo grupo B - (ver Streptococcus grupo B).
- Estrongiloidiasis - (Ver Strongyloides stercoralis)
- Exudación uretral o vaginal (Neisseria gonorrhoeae, Chlamydia trachomatis, Ureaplasma urealyticum, Ureaplasma parvum, Candida albicans, Trichomonas vaginalis): Diagnóstico molecular (PCR).
- Fasciola hepática - Anticuerpos; Diagnóstico molecular (PCR).
- Fatiga crónica, Síndrome de …, (CFS: Chronic Fatigue Syndrome) o encefalomielitis miálgica (ME: Myalgic Encephalomyelitis) (ME/CFS): consideraciones sobre su etiología infecciosa.
- Fatiga Crónica, Síndrome de …, - Relación con micoplasmas en sangre (Mycoplasma pneumoniae, Mycoplasma hominis, Mycoplasma fermentans y Mycoplasma penetrans: Diagnóstico molecular (PCR y secuenciación).
- Fiebre africana por picaduras de garrapatas (ATBF: African Ticks Bite Fever) por Rickettsia africae - (Ver Rickettsia spp.).
- Fiebre amarilla, Virus de la ..., (YFV: Yellow Fever virus) (Flavirivirus, Flaviviridae) - (Ver Arbovirus).
- Fiebre botonosa mediterránea - (Ver Rickettsia spp.)
- Fiebre del Nilo Occidental, Virus de ..., (WNFV: West Nile Fever virus) (Flavivirus, Flaviviridae) - (Ver Arbovirus).
- Fiebre hemorrágica de Crimea-Congo (CCHF: Crimean-Congo Hemorrhagic Fever): diagnóstico molecular (RT-PCR).
- Fiebre hemorrágica de Omsk, virus de la ..., (OHFV: Omsk Haemorrhagic fever virus) (Flavirivirus, Flaviviridae) - (Ver Arbovirus).
- Fiebre manchada mediterránea (Ver Rickettsia spp.)
- Fiebre por garrapatas de Colorado, Virus de ..., (Orbivirus) - (Ver Arbovirus).
- Fiebre por Phlebotomus de Nápoles, Virus de la ..., (SFNV: Sandfly Naple virus) (Phlebovirus, Bunyaviridae) - (Ver Arbovirus).
- Fiebre por Phlebotomus de Sicilia, Virus de la ..., (SFSV: Sandfly Sicilian virus)) (Phlebovirus, Bunyaviridae) - (Ver Arbovirus).
- Fiebre por Phlebotomus de Toscana, Virus de la ..., (TOSV: Toscana Sandfly virus) (Phlebovirus, Bunyaviridae) - (Ver Arbovirus).
- Fiebre Q - (ver Coxiella burnetii).
- Fiebre recurrente endémica transmitida por garrapatas blandas (Ornithodorus spp.).
- Fiebre recurrente epidémica transmitida por piojos - (Ver Borrelia recurrentis).
- Fiebres hemorrágicas, virus de ..., - (Ver cada virus causal).
- Filarias - Filariasis: Síndromes clínicos, especies causantes y pruebas diagnósticas - Examen microscópico; Anticuerpos totales (con antígeno de Acanthocheilonema viteae), Diagnóstico molecular (PCR), Identificación de especie.
- Fort Morgan, Virus ..., (Alphavirus, Togaviridae) - (Ver Arbovirus).
- Francisella tularensis (Tularemia) - Cultivo; Diagnóstico molecular (PCR).
- FTA-Abs - (Ver Treponema pallidum).
- Fusarium spp. (F. solani, F. oxysporum, F. verticilloides, F. chlamydosporum, F. sacchari, y otras especies): Aislamiento en cultivo; Diagnóstico molecular (PCR); Identificación molecular de especie (secuenciación).
- Gardnerella vaginalis - Cultivo; Diagnóstico molecular (PCR).
- Genética humana - Diagnóstico genético molecular (Ver cada enfermedad en Área específica de Mutaciones de genes humanos).
- Getah, Virus ..., (Alphavirus, Togaviridae) - (Ver Arbovirus).
- Giardia duodenalis (Giardia lamblia) - Examen microscópico; Detección de antígeno; Diagnóstico molecular (PCR).
- Glucano (1-3-β-D-Glucano) - Detección de (1-3) β-D glucano.
- Gnathostoma spinigerum, G. hispidum, G. doloresi, G. nipponicum: Diagnóstico molecular (PCR).
- Graham, técnica - Examen microscópico.
- Gram, tinción de ..., - Exámen microscópico.
- Gripe aviar - (Ver InfluenzaA H5N1 y H7N9).
- Gripe - (Ver Influenza A, Influenza B o Influenza A y B).
- HACEK, Bacterias: Cultivo; Diagnóstico molecular (PCR).
- Haemophilus ducreyi (chancro blando, chancroide) - Diagnóstico molecular (PCR).
- Haemophilus influenzae b - Anticuerpos anti-Haemophilus influenzae serogrupo b; Diagnóstico molecular (PCR).
- Halitosis, Bacterias causantes de ..., - (Ver Periodontitis).
- Haemophilus influenzae - Tipado antigénico (serotipificación); Diagnóstico molecular (PCR); Tipado antigénico molecular.
- Hantavirus - Diagnóstico molecular (RT-PCR).
- Haplorchis taichui (Ver Opisthorchis spp.).
- Helicobacter pylori - Antígeno en heces; Cultivo; Anticuerpos IgA, IgM e IgG; Diagnóstico molecular (PCR).
- Helicobacter pylori - Genotipos (PCR y secuenciación).
- Helicobacter pylori: resistencias genotípicas a claritromicina, amoxicilina, metronidazol, levofloxacino, tetraciclinas y rifabutina – PCR y secuenciación.
- Helmintos - Examen microscópico; Identificación macroscópica; Identificación molecular (PCR y secuenciación).
- Hemocultivo.
- Hepatitis A (Hepatovirus) - Anticuerpos IgM; Anticuerpos totales; Diagnóstico molecular (RT-PCR); Tipado (secuenciación).
- Hepatitis B – Antígeno HBs (cuantitativo y confirmación); Antígeno Hbe; Anticuerpos anti-HBc, anti-HBe y anti-HBc IgM; Diagnóstico molecular (PCR); Carga viral; Genotipo; Mutuaciones de resistencia.
- Hepatitis B, virus - Mutaciones de resistencia a fármacos: Identificación molecular (PCR y secuenciación).
- Hepatitis C - Anticuerpos totales e IgM; Immunoblot (WB); Diagnóstico molecular (RT-PCR); Carga viral; Genotipo; Poliforfismo Q80K y genético IL-28; Resistencia a inhibidores de proteasa (NS3/4A). inhibidores de NS5A e inhibidores de polimerasa (NS
- Hepatitis C, Virus de ..., - Comparación de secuencias genómicas de virus de hepatitis C en muestras de plasma. Análisis filogenéticos.
- Hepatitis C virus (VHC / HCV) en líquidos de diálisis: concentración y detección molecular por PCR en tiempo real.
- Hepatitis D (delta) virus - Relación con el origen geográfico y el curso clínico de la enfermedad - Antígeno; Anticuerpos totales e IgM; Diagnóstico molecular (RT-PCR); Genotipado HDV-1 a HDV-8 (RT-PCR y secuenciación).
- Hepatitis E - Virus de la hepatitis E – Anticuerpos IgM, anticuerpos IgG, detección molecular (RT-PCR) y genotipado (RT-PCR y secuenciación) – Genotipos 1 a 8 (VHE-1 a VHE-8).
- Hepatitis G - Diagnóstico molecular (RT-PCR para región 5´UTR y región NS3).
- Hepatovirus - (Ver Picornaviridae-Picornavirus).
- Herpes simple1 y/o 2 - Anticuerpos IgG anti-VHS-1 y VHS-2; Anticuerpos IgM anti-VHS-1 y VHS-2; Cultivo convencional; Diagnóstico molecular (PCR).
- Herpes simple (Herpes simplex). Resistencias a aciclovir, penciclovir, foscarnet, cidofovir y adefovir (genes UL23-timidinaquinasa- y UL30 -ADN-polimerasa-): Pruebas genotípicas (PCR y secuenciación) y fenotípicas (cultivo e IC50).
- Herpesvirus humano tipo 6 (Human Herpesvirus type 6 –HHV-6). Carga viral (viral load).
- Herpesvirus humano tipo 8 (HHV-8) - Anticuerpos IgG e IgM; Diagnóstico molecular (PCR).
- Herpesvirus tipo 6 - Anticuerpos IgM; Anticuerpos IgG; Diagnóstico molecular (PCR); Carga viral.
- Herpesvirus tipo 7 - Diagnóstico molecular (PCR).
- HHV-6 - (Ver Herpesvirus tipo 6).
- HHV-7 - (Ver Herpesvirus tipo 7).
- HHV-8 - (Ver Herpesvirus tipo 8).
- Hidatidosis - (Ver Echinococcus granulosus y Echinococcus multilocularis).
- Highlands J, Virus ..., (Alphavirus, Togaviridae) (Ver Arbovirus).
- Histoplasma capsulatum - Cultivo; Diagnóstico molecular (PCR).
- Hongos dermatofitos - Examen microscópico; Cultivo convencional; Identificación de especies (secuenciación); diagnóstico molecular (PCR).
- Hongos - Examen microscópico; Cultivos; Antifungigrama para levaduras y hongos filamentosos; Diagnóstico molecular (PCR); Identificación por secuenciación.
- HPV - (Ver Papillomavirus humano).
- HTLV-III (nuevo HTLV III, diferente de denominación inicial de virus VIH) - Diagnóstico molecular (RT-PCR).
- HTLV-1 y/o HTLV-2 - Anticuerpos; Confirmación de anticuerpos; Diagnóstico molecular (ARN viral por RT-PCR viral y ADN proviral por PCR).
- Hymenolepis diminuta, Hymenolepis nana: Observación microscópica; Diagnóstico molecular (PCR).
- Identificación de cepas - Bacterias aerobias; Bacterias anaerobias; Micobacterias; Hongos; Protozoos; Helmintos; Artrópodos.
- Igbo-Ora, Virus ..., (Alphavirus, Togaviridae) - (Ver Arbovirus).
- Ilheus, Virus ..., (ILHV: Ilheus virus) (Flavivirus, Flaviviridae) - (Ver Arbovirus).
- Infección respiratoria - Anticuerpos anti-Adenovirus, Influenza A y B, Parainflenza 1, 2 y 3; Virus respiratorio sincitial; Chlamydophila pneumoniae, Chlamydophila psittaci; Coxiella burnetii, Legionella pneumophila; Mycoplasma pneumoniae; O
- Infecciones bacterianas o fúngicas en muestras sin flora habitual normal – Diagnóstico rápido mediante amplificación de gen de 16S rRNA o 18S-ITS1 e ITS2, respectivamente: Diagnóstico molecular (PCR y secuenciación).
- Infecciones fúngicas en pacientes trasplantados de médula ósea - Etiología: Pruebas microbiológicas convencionales; Diagnóstico molecular (PCR); Identificación de especies (secuenciación).
- Infecciones y enfermedades causadas por aves de compañía (Zoonoses in pet birds): microorganismos implicados, afectación de personas y diagnóstico microbiológico en IVAMI.
- Influenza A estacional - Anticuerpos IgA, IgG e IgM; Antígeno en secrección respiratoria; Cultivo; Diagnóstico molecular (RT-PCR). Influenza A H1N1, AH3N2, H5N1, H7N9 u otros.
- Influenza A (H1N1) pdm09 (nuevo virus) – Cultivo; Anticuerpos tipo específicos; Diagnóstico molecular (RT-PCR); Tipado por secuenciación; Resistencia a los inhibidores de neuraminidasa (secuenciación).
- Influenza A H5N1 - Diagnóstico molecular (RT-PCR).
- Influenza A H7N9 - Diagnóstico molecular (RT-PCR).
- Influenza A y B estacionales - Cultivo de virus Influenza ; Diagnóstico molecular (RT-PCR).
- Influenza B estacionales - Anticuerpos IgA, IgG e IgM; Antígeno en secreción respiratoria; Cultivo; Diagnóstico molecular (RT-PCR).
- Isospora belli (Cystoisospora belli - Examen microscópico; Diagnóstico molecular (PCR).
- JC, virus ...,(Polyomavirus, Leucoencefalopatía multifocal progresiva) - Diagnóstico molecular (PCR).
- Kingella kingae, - Cultivo; Diagnóstico molecular (PCR para toxina).
- Klebsiella granulomatis (Donovanosis) (Ver Donovanosis).
- Klebsiella pneumoniae - Diagnóstico molecular de los genes magA, rmpA, wzcK1, wzcK2 (PCR).
- Klebsiella pneumoniae subsp. rhinoscleromatis - agente causal del rinoescleroma: diagnóstico e identificación molecular (PCR)
- Kobuvirus - (Ver Picornaviridae - Picornavirus).
- Kunjin, Virus ..., (KUNV: Kunjin virus) (Flavirivirus, Flaviviridae) - (Ver Arbovirus).
- Kyzylagach, Virus ..., (Alphavirus, Togaviridae) - (Ver Arbovirus).
- LAL (Prueba cromogénica cuantitativa LAL) (Ver Endotoxinas en área de Microbiología clínica).
- Larva migrans cutánea (Ver Ancylostoma caninum y Ancylostoma braziliensis en Área de Microbiología Veterinaria Molecular).
- Larva migrans visceral (Ver Toxocariasis: Toxocara canis y Toxocara cati).
- Legionella pneumophila – Anticuerpos totales, IgG e IgM; Antígeno en orina; Cultivo ambiental; Cultivo en muestras respiratorias; Diagnóstico molecular (PCR); Identificación de otras especies de Legionella.
- Legionella pneumophila - Compación molecular epidemiológica de cepas (7 genes: flaA, pilE, asd, mip, mompS, proA y/o neuA): Amplificación molecular (PCR) y secuenciación.
- Leishmania spp. - Examen microscópico; Antígeno; Cultivo; Anticuerpos totales; Diagnóstico molecular (PCR en tiempo real); Identificación de especies (secuenciación).
- Leptospira interrogans y sus serovars (icterohaemorragiae, hebdomadis, autumnalis, canicola, hyos, bataviae, javanica, pomona, ballum, grypothyphosa, panama, hardjo, celledoni, ...)-Cultivo; Anticuerpos por MAT; Diagnóstico molecular.
- Linfogranuloma venéreo (Chlamydia trachomatis tipos LGV 1, 2 y 3): Diagnóstico molecular (PCR).
- Listeria monocytogenes - Control de la infección asintomática por Listeria monocytogenes en la embarazada.
- Listeria monocytogenes - Cultivo; Diagnóstico molecular (PCR); Serotipado molecular (1/2a, 1/2b, 1/2c, 3a, 3b, 3c, y 4b).
- Loa loa (ver Filarias - Filariasis).
- Lues - (Ver Treponema pallidum).
- Lyme, Enfermedad de ..., - (Ver Borrelia burgdorferi sensu stricto y Borrelia burdorferi sensu lato).
- Malaria - (Ver Plasmodium spp.).
- Malassezia furfur (Pitiriasis versicolor) y Malassezia spp. - Examen microscópico; Cultivo con requerimientos especiales; Diagnóstico molecular (PCR); Identificación de especie (secuenciación).
- Malassezia pachydermatis y otras especies de Malassezia: pruebas de sensibilidad a los antifúngicos (Ver Malassezia pachydermatis y otras especies de Malassezia en área de Microbiología veterinaria molecular.
- Mansonella ozzardi - (Ver Filarias - Filariasis).
- Mansonella perstans - (Ver Filarias - Filariasis).
- Mansonella streptocerca - (Ver Filarias - Filariasis).
- Marburg, Virus ..., - Diagnóstico molecular (RT-PCR).
- Mayaro, Virus ..., (Alphavirus, Togaviridae - (Ver Arbovirus).
- Melioidosis (Ver Burkholderia pseudomallei (Melioidosis).
- Meningitis aséptica - Enterovirus; Herpes simple virus tipo 1 y 2; Virus Varicella-Zoster; Virus de Coriomeningitis lifocitaria; Virus JC; Arbovirus; Leptospira interrogans. (Ver cada agente etiológico).
- Meningitis bacteriana en adultos de menos de 50 años - Neisseria meningitidis y Streptococcus pneumoniae.
- Meningitis bacteriana en adultos mayores de 50 años e inmunosupresión - Neisseria meningitidis, Streptococcus pneumoniae, Listeria monocytogenes y Bacilos gramnegativos.
- Meningitis bacteriana en niños - Neisseria meningitidis, Streptococcus pneumoniae y Haemophilus influenzae tipo b).
- Meningitis bacteriana en prematuros y recién nacidos- Streptococcus agalactiae (grupo B), Escherichia coli K1 y Listeria monocytogenes.
- Meningitis bacteriana en traumatismos craneales, drenajes, reservorio, inmunodeprimidos ..., - Staphylococcus spp., Pseudomonas spp., Bacilos gramnegativos, Bacterias corineformes, Propionibacterium acnes.
- Meningitis bacteriana tras implante coclear.
- Meningitis/meningoencefalitis fúngicas - Cryptococcus neoformans, Candida spp. y en casos de países exóticos (Histoplasma, Coccidioides, Blastomyces).
- Meningitis/meningoencefalitis parasitarias - Toxoplasma gondii, Toxocara canis, Neurocisticercosis, Amebas de vida libre, Angyostrongylus cantonensis, Gnathostoma spinigerum.
- Meningitis/meningoencefalitis viral - Enterovirus; Herpes simple virus tipo 1 y 2; Virus Varicella-Zoster; Virus de Coriomeningitis linfocitaria; Virus JC; Arbovirus.
- Metalobetalactamasas - (Ver Beta-lactamasas).
- Metapneumovirus - Diagnóstico molecular (RT-PCR).
- Micobacterias - Examen microscópico; Cultivo convencional (L-J); Cultivo sistema MGIT; Sensibilidad convencional a fármacos de primera, segunda y tercera línea; Identificación molecular; Diagnóstico molecular (PCR); Mutuaciones de resistencia.
- Micoplasmas contaminantes de cultivos celulares - Diagnóstico molecular (PCR) e identificación molecular (secuenciación).
- Micoplasmas urogenitales (Mycoplasma hominis, Mycoplasma genitalium, Ureaplasma urealyticum, Ureaplasma parvum) - Resistencias a los antimicrobianos: Identificación molecular (PCR y secuenciación).
- Micoplasmas - (Ver cada especie: Mycoplasma genitalium, Mycoplasma hominis, Ureaplasma urealyticum, Ureaplasma parvum, Mycoplasma pneumoniae).
- Microsporidium - Microsporidia (Encephalitozoon spp., Enterocytozoon bieneusi y otros géneros): Diagnóstico molecular; Identificación de especies (PCR y secuenciación).
- Middelburg, Virus ..., (Alphavirus, Togaviridae) - (Ver Arbovirus).
- Molluscum contagiosum, Virus del …, - Diagnóstico molecular (PCR) en muestras clínicas; Detección en aguas de piscinas y otros sistemas hídricos compartidos.
- Monkeypox virus (MPXV) - (Ver Poxvirus de origen animal).
- Mononucleosis - (Ver Epstein Barr, Virus de ...,).
- Moquillo, Virus del …, (distemper virus) en personas: Diagnóstico molecular (RT-PCR).
- Morganella morganii - Cultivo; Identificación.
- Mucormicosis - (Ver Zygomycetes).
- Mycobacterium abscessus-Mycobacterium chelonae complex: Diagnóstico molecular (PCR); Mutaciones de resistencia a macrólidos -genes erm(41); rrl-; Mutaciones de resistencia a aminoglucósidos -gen rrs- (secuenciación).
- Mycobacterium avium - (Ver Micobacterias).
- Mycobacterium bovis: Diagnóstico molecular (PCR).
- Mycobacterium immunogenum (Complejo Mycobacteium chelonae-Mycobacterium abscessus) - Implicaciones en la industria metalúrgica y relacionada, y en infecciones hospitalarias: Cultivo; PCR en tiempo real cualitativa o cuantitativa; Iden
- Mycobacterium leprae: Lepra - Diagnóstico molecular (PCR).
- Mycobacterium marinum - Cultivo; Diagnóstico molecular (PCR).
- Mycobacterium spp. - Diagnóstico molecular (PCR).
- Mycobacterium tuberculosis complex - Cultivo; Diagnóstico molecular (PCR); Pruebas de sensibilidad a fármacos antituberculosos; Mutaciones de resistencia (amplificación y secuenciación de genes rpoB, katG, mabA, embB, pncA, rpsL, rrs, gyr
- Mycoplasma fermentans: Infecciones respiratorias y genitourinarias - Diagnósico molecular (PCR); Identificación de especie (PCR y secuenciación).
- Mycoplasma genitalium: Diagnóstico molecular (PCR); Resistencia a macrólidos y quinolonas (secuenciación).
- Mycoplasma hominis - (Ver Mycoplasma spp. genitales).
- Mycoplasma penetrans: diagnóstico molecular (PCR).
- Mycoplasma pneumoniae - Anticuerpos IgG; Anticuerpos IgM; Diagnóstico molecular (PCR).
- Mycoplasma spp. genitales - Cultivo; Diagnóstico molecular (PCR); Identificación de especie (secuenciación).
- Naegleria spp. - Diagnóstico molecular (PCR).
- Ndumu, Virus ..., (Alphavirus, Togaviridae) - (Ver Arbovirus).
- Neisseria gonorrhoeae - Cultivo; Diagnóstico molecular (PCR).
- Neisseria meningitidis - Anticuerpos anti-Neisseria meningitidisserogrupos A+C y serogrupo C; Anticuerpos bactericidas serogrupos A, B, C, Y y W135 (SBA: Serum Bactericidal Assay); Diagnóstico molecular (PCR).
- Newcastle, Virus de enfermedad de ..., - Diagnóstico molecular (RT-PCR).
- Nilo Occidental, Virus de fiebre del ..., - (Ver West Nile fever virus: WNFV).
- Nipah virus - Diagnóstico molecular (PCR).
- Nocardia - Anticuerpos totales; Cultivo; Diagnóstico molecular (PCR); Identificación de especie (secuenciación).
- Norovirus - Diagnóstico molecular (PCR en tiempo real e identificación de tipo por secuenciación (Ver Norovirus y Sapovirus en área de Microbiología de alimentos)..
- Norwalk virus y relacionados - (Ver Norovirus).
- O´Nyong-Nyong, Virus ..., (ONNV: O´Nyong´Nyong virus) (Alphavirus, Togaviridae) - (Ver Arbovirus).
- Ockelbo, Virus ..., (Alphavirus, Togaviridae) - (Ver Arbovirus).
- Oeste del Nilo, Virus del ..., (WNV: West Nile virus) (Flavirivirus, Flaviviridae) - (Ver Arbovirus).
- Olor corporal, sudoración y bacterias implicadas.
- Olor de pies (pies malolientes): Causas, bacterias implicadas y medidas de control.
- Onchocerca volvulus - (Ver Filarias - Filariasis).
- Onicomisosis (Tinea unguium) - Hongos causales: Cultivo; Identificación molecular (PCR y secuenciación).
- Opisthorchis spp. (O. viverrini, O. felineus) - Examen microscópico de huevos en heces; Diagnóstico molecular (PCR); Identificación molecular de especies (secuenciación).
- Orf virus (ORFV) - (Ver Poxvirus de origen animal).
- Oropuche, Virus ..., (Bunyavirus, Bunyaviridae) - (Ver Arbovirus).
- Paludismo - (Ver Plasmodium spp.).
- Paperas - (Ver Parotiditis).
- Papillomavirus - Diagnóstico molecular (PCR); Tipado de Papillomavirus.
- Papilomavirus humano (VPH / HPV) – Cuantificación de la expresión de mRNA de oncogenes E6 y E7: PCR en tiempo real cuantitativa (RT-rt qPCR).
- Papovavirus SV-40 - Diagnóstico molecular (PCR).
- Paracoccidioides brasiliensis - Cultivo; Diagnóstico molecular (PCR).
- Parainfluenza - Anticuerpos IgG e IgM (Parainfluenza 1, 2 y 3); Antígeno en secreción respiratoria; Cultivo de virus; Diagnóstico molecular (RT-PCR).
- Paramixovirus (Paramyxovirus): Diagnóstico molecular; Identificación molecular de especies (PCR y secuenciación).
- Parapoxvirus - (Ver Poxvirus de origen animal).
- Paravaccinia - (Ver Poxvirus de origen animal).
- Parechovirus - (Ver Picornaviridae-Picornavirus).
- Parotiditis, virus - Anticuerpos IgG; Anticuerpos IgM; Diagnóstico molecular (PCR).
- Parvovirus B-19 (Erythrovirus B19) - Anticuerpos IgG; Anticuerpos IgM; Diagnóstico molecular (PCR).
- Pasteurella spp. (Pasteurella multocida subsp. multocida y otras especies) - Cultivo; Diagnóstico molecular (PCR).
- PCR - (Ver cada microorganismo).
- Pegivirus: Diagnóstico molecular (PCR).
- Periodontitis, Bacterias causantes de ..., (Aggregatibacter actinomycetemcomitans, Campylobacter rectus, Porphyromonas gingivalis, Prevotella intermedia, Tannerella forsythia, Treponema denticola) - Diagnóstico molecular (PCR).
- PFGE (Pulse Field Gel Electrophoresis) para comparación de cepas.
- Picornaviridae - Picornavirus - Diagnóstico molecular (RT-PCR); Identificación molecular (secuenciación).
- Plasmodium spp.- Examen microscópico; Anticuerpos totales, IgG e IgM; Diagnóstico molecular (PCR); Identificación molecular de especies y Resistencia a fármacos (PCR y secuenciación).
- Plesiomonas shigelloides – Cultivo microbiológico e identificación; Diagnóstico molecular (PCR).
- Pneumocystis jirovecci (antes Pneumocystis carinii) - Diagnóstico molecular (PCR); Mutaciones de resistencia al tratamiento de primera línea (TMP-SMX) (PCR y secuenciación.
- Poliovirus 1, 2 y 3 (actualmente serotipos de la especie Enterovirus C) - Anticuerpos por neutralización para Poliovirus 1, 2 y 3; Diagnóstico molecular (PCR); Identificación molecular (secuenciación); Tipado antigénico.
- Polyomavirus: Ver BK virus y JC virus).
- Poxvirus de origen animal - Diagnóstico molecular (PCR) e identificación por secuenciación.
- PRA - (Ver Micobacterias, Identificación molecular PRA).
- Priones - Detección Proteina PrPsc.
- Proctitis (Neisseria gonorrhoeae, Chlamydia trachomatis, Ureaplasma urealyticum, Virus Herpes simple tipos 1 y 2): Detección molecular (PCR).
- Propionibacterium acnes - Cultivo anaerobio; Diagnóstico molecular (PCR).
- Prostatitis: etiología y diagnóstico - Cultivos; Identificación; Diagnóstico molecular (PCR).
- Prototheca spp. - Interés en patología humana y animal y en fuentes de contaminación (muestras ambientales, alimentos, y muestras de origen animal)(ver en área de Microbiología de aguas)
- Protozoos intestinales: prueba combinada por PCR en tiempo real (Giardia lamblia, Cryptosporidium parvum/Cryptosporidium hominis, Entamoeba histolytica, Dientamoeba fragilis).
- Protozoos - Examen microscópico; Cultivo cuando es posible; Diagnóstico molecular (PCR).
- Pseudocowpox virus (PCPV) - (ver Poxvirus de origen animal).
- Pseudomonas aeruginosa - Cultivo; Diagnóstico molecular (PCR).
- Rabia: Diagnóstico de infeción en animales mordedores o personas mordidas - Aislamiento del virus (inoculación en ratón); Detección de antígeno (inmunofluorescencia); Diagnóstico molecular (RT-PCR); Anticuerpos específicos (neutralización); Genoti
- RAPD (Random Amplification of Polymorphic DNA) para comparación epidemiológica de cepas.
- Reacción en cadena de la polimerasa - (Ver PCR).
- Resistencia a glucopéptidos (vancomicina y teicoplanina) en Enterococcus spp. Fenotipos VanA, VanB, VanD, y otros menos frecuentes (VanC, C2/3, E, F, G, L, M): Diagnóstico molecular por amplificación (PCR) y secuenciación.
- Resistencia genotípica a los antimicrobianos - Cualquier antimicrobiano (PCR y secuenciación).
- Resistencia genotípica a fluoquinolonas - genes qnrA, gyrA, parC, marR, acrR: Diagnóstico molecular (PCR y secuenciacion).
- Respiratorio sincitial, Virus ..., tipo A - Diagnóstico molecular (PCR).
- Respiratorio sincitial, Virus, (VRS) - Anticuerpos IgG; Anticuerpos IgM; Anticuerpos totales; Antígeno en secreción respiratoria; Cultivo; Diagnóstico molecular (PCR).
- Rhinovirus (actualmente especies de Rhinovirus A, B y C) - Diagnóstico molecular (PCR).
- Rickettsia africae - (Ver Rickettsia spp.).
- Rickettsia conorii - (Ver Rickettsia spp.).
- Rickettsia spp.: grupo tifus (R.prowazekii, R.typhi), grupo de las fiebres manchadas (R.conorii,R.africae,R.slovaca,R.rickettsii,R.sibirica,R.japonica,R.australis, ...), tifus pustuloso (R.akari)-Cultivo,Anticuerpos,PCR
- Rift Valley Fever virus (+/-ssRNA ambisense, -ssRNA segments L y M, +/-ssRNA segment S, Bunyavirales, Phenuiviridae, Phlebovirus): Diagnóstico molecular (RT-PCR).
- Río Ross, Virus del ..., (RRV: Ross River virus) (Alphavirus, Togaviridae) - (Ver Arbovirus).
- Rochalimaea - Diagnóstico molecular (PCR).
- Rocio, Virus ..., (ROCV: Rocio virus) (Flavivirus, Flaviviridae) - (Ver Arbovirus).
- Rotavirus - Antígeno en heces; Diagnóstico molecular (PCR).
- RPR - (Ver Treponema pallidum).
- Rubéola - Anticuerpos IgG; Anticuerpos IgM; Avidez de Anticuerpos IgG; Diagnóstico molecular (PCR).
- Sagiyama, Virus ..., (Alphavirus, Togaviridae) - (Ver Arbovirus).
- Salmonella spp - Cultivo; Diagnóstico molecular (PCR); Tipado antigénico molecular O y H; Anticuerpos frente a antígenos O y H; Comparación molecular de cepas.
- Sapovirus- (Ver Norovirus y Sapovirus en área de Microbiología de alimentos).
- Sarampión - Aislamiento en cultivo; Anticuerpos IgG; Anticuerpos IgM; Cuantificación de anticuerpos por neutralización; Diagnóstico molecular (PCR).
- Sarampión, virus del ..., - Identificación de cepas naturales (salvajes, Wild strains) y vacunales y su genotipado por genes H (hemagutinina) y N (neuraminidasa): Identificación molecular (secuenciación).
- Sarcoptes scabiei – Agente etiológico de la sarna o escabiosis: Diagnóstico molecular (PCR).
- Schistosoma spp. - (ver Esquistosomiasis).
- Secuenciación de ácidos nucleicos - Cualquier aplicación en identificación de especies de microorganismos; Comparación molecular de microorganismos; Mutaciones de resistencia; Mutaciones de enfermedades genéticas.
- Serología atípica respiratoria - Mycoplasma pneumoniae, Chlamydophila pneumoniae y Legionella pneumophila (ver en cada agente).
- Serratia marcescens y Serratia spp.: Aislamiento en cultivo; Diagnóstico molecular (PCR y PCR con secuenciación).
- Shigella (Shigella dysenteriae, S. sonnei, S. flexneri, S. boydii) - Cultivo; Diagnóstico molecular (PCR); Tipado antigénico.
- Sífilis - (Ver Treponema pallidum).
- Sindbis, Virus ..., (SV: Sindbis virus) (Alphavirus, Togaviridae) - (Ver Arbovirus).
- Sporothrix schenckii - Examen microscópico; Cultivo; Diagnóstico molecular (PCR).
- Staphylococcus aureus - Resistencia a meticilina; Tipado SCCmec; Tipado SPA; Tipado MSLT; Toxina TSST-1 y toxina exfoliativa (PCR).
- Staphylococcus aureus – Toxina de Panton-Valentine – Genes lukS-PV y lukF-PV: Cultivo; diagnóstico molecular (PCR).
- Staphylococcus pseudointermedius: Diagnóstico molecular (PCR).
- Staphylococcus spp., Identificación de especies de Staphylococcus coagulasa negativos (S. capitis, S. caprae, S. epidermidis, S. haemolyticus, S. hominis, S. lugdunensis, S. pasteuri, S. saprophyticus, S. warneri, S. xylosus):
- Streptobacillus moniliformis – Fiebre por mordedura de rata; Fiebre de Haverhill
- Streptococcus agalactiae grupo B - Afectación de los recién nacidos y estado de portador en la embarazada: Cultivo; Diagnóstico molecular (PCR).
- Streptococcus pneumoniae - Anticuerpos específicos de tipo; Anticuerpos opsonofagocitarios; Antígeno en orina; Diagnóstico molecular (PCR); Genes erm y mef; Tipado antigénico capsular (PCR e hinchazón de cápsula -Quellung-).
- Streptococcus pyogenes - Detección de especie en muestras clínicas: Cultivo; Diagnóstico molecular (PCR).
- Streptococcus pyogenes – Diagnóstico molecular (PCR); Tipado de proteina M (gen emm); Gen de toxina de Síndrome Shock Tóxico-like; Genes de toxinas eritrogénicas SpeA, SpeB y SpeC.
- Strongyloides stercoralis (Estrongiloidiasis): Examen microscópico; Cultivo de heces (método de Harada-Mori o método de Baermann); Anticuerpos IgG; Diagnóstico molecular (PCR).
- Taenia asiática - Diagnóstico molecular (PCR).
- Taenia saginata - Diagnóstico molecular (PCR).
- Taenia solium - Anticuerpos IgG; Diagnóstico molecular (PCR).
- Tétanos - (Ver Clostridium tetani).
- Thelaziosis (Thelazia callipaeda) (Ver: Thelaziosis -Thelazia callipaeda- en Área de Microbiología Veterinaria molecular).
- Tick-borne encephalitis virus (TBEV) - (Ver Arbovirus).
- Toscana, virus ..., (Phlebovirus, Bunyaviridae) - (Ver Arbovirus).
- Toxocariasis (Larva migrans visceral, larva migrans ocular, toxocariasis encubierta) (Toxocara canis y Toxocara cati) - Anticuerpos IgG; Diagnóstico molecular (PCR); Identificación molecular de especies (PCR y secuenciación).
- Toxoplasma gondii - Anticuerpos IgA; Anticuerpos IgG; Anticuerpos IgM; Avidez de anticuerpos IgG; Diagnóstico molecular (PCR).
- Treponema pallidum - Examen microscópico en campo oscuro; Diagnóstico molecular (PCR); Anticuerpos reagínicos (RPR y VDRL); Anticuerpos treponémicos FTA-ABS IgG y FTA-ABS IgM.
- Triquinosis-Triquina (Trichinella spp.) – Detección en animales y alimentos: triquinoscopia, digestión artificial, e identificación a nivel de especie (PCR y secuenciación). Diagnóstico en personas infectadas.
- Trichomonas vaginalis - Examen microscópico; Cultivo; Diagnóstico molecular (PCR).
- Trichomonas vaginalis - Resistencia a metronidazol (nitroimidazoles): Identificación molecular de mutaciones de resistencia (secuenciación).
- Trichuris trichiura: Observación microscópica; Diagnóstico molecular (PCR).
- Tropheryma whipplei (Enfermedad de Whipple) - Diagnóstico molecular (PCR).
- Trypanosoma brucei rhodesiense y Trypasoma brucei gambiense - Examen microscópico; Diagnóstico molecular (PCR).
- Trypanosoma cruzi: Anticuerpos IgG e IgM; Examen microscópico; Cultivo en medio líquido; Diagnóstico molecular (PCR).
- Trypanosoma rangeli - Diagnóstico molecular (PCR); Examen microscópico.
- Tularemia - (Ver Francisella tularensis).
- Úlceras genitales (Treponema pallidum, Haemophilus ducreyi, Chlamydia trachomatis tipos LGV 1, 2 y 3): Diagnóstico molecular (PCR).
- Una, Virus ..., (UNAV: UNA virus) (Alphavirus, Togaviridae) - (Ver Arbovirus).
- Ureaplasma parvum - (Ver Mycoplasma spp. genitales).
- Ureaplasma urealyticum - (Ver Mycoplasma spp. genitales).
- Uretritis (Neisseria gonorrhoeae, Chlamydia trachomatis, Ureaplasma urealyticum, Ureaplasma parvum, Trichomonas vaginalis, Virus Herpes simple tipos 1 y 2): Diagnóstico molecular (PCR).
- Vaccinia virus (VACV) - (Ver Poxvirus de origen animal).
- Vaginitis y vulvovaginitis (Trichomonas vaginalis, Candida albicans): Diagnóstico molecular (PCR).
- Vaginosis (Gardnerella vaginalis, Mobiluncus spp.): Diagnóstico molecular (PCR).
- Valle del Rift, Virus de la fiebre del ..., (Bunyavirus, Bunyaviridae) - (Ver Arbovirus).
- Varicella-zoster, Virus ..., - Aislamiento en cultivo; Anticuerpos IgG; Anticuerpos IgM; Anticuerpos totales; Avidez de anticuerpos IgG; Detección de antígeno; Diagnóstico molecular (PCR).
- VDRL - (Ver Treponema pallidum).
- Verrugas anogenitales (Papilomavirus -HPV: Human Papillomavirus): Detección molecular (PCR) .
- Vibrio cholerae cholerae biotipo clásico; Vibrio cholerae biotipo El Tor; Serogrupos O1 y O139 -Bengal-, y Vibrio cholerae NAG (no-O1, No-O139) - Identificación y detección de producción de toxinas.
- Vibrio parahaemolyticus Kanagawa positivo: Detección molecular (PCR).
- VIH-1 - Diagnóstico molecular de ARN viral (RT-PCR) y ADN proviral (PCR); Carga viral; Antígeno p24; Anticuerpos (ELISA y confirmación por W-B); Mutuaciones de resistencia a inhibidores de transcriptasa, de proteasa, de integrasa y de fusión; Tropi
- VIH-2 - Carga viral de virus de inmunodeficiencia humana tipo 2 (VIH-2) (HIV-2 viral load).
- VIH-2 - Diagnóstico molecular de ARN viral (RT-PCR) y ADN proviral (PCR); Anticuerpos por immunoblot (W-B); Resistencias genotípica a inhibidores de transcriptasa reversa (NRTI), inhibidores de proteasa (PI) e inhibidores de integrasa.
- Viruela: Diagnóstico molecular (PCR).
- Virus Ebola - Diagnóstico molecular (RT-PCR).
- Virus respiratorio sincitial (VRS) – (Ver Respiratorio sincitial, Virus ...,).
- Virus respiratorios en secreción - Detección de sus antígenos (incluyendo Influenza A, Influenza B, Parainfluenza 1, 2 y 3, Adenovirus, Virus respiratorio siincitial).
- West Nile fever virus (WNFV) (Flavirivirus, Flaviviridae ) - (Ver Arbovirus).
- Whataroa, Virus ..., (Alphavirus, Togaviridae) - (Ver Arbovirus).
- Whipple, Enfermedad de ..., - (Ver Tropheryma whipplei)
- Wuchereria bancrofti - (Ver Filarias - Filariasis).
- XMRV (Xenotropic Murine Leukemia virus-related virus) - Diagnóstico molecular (PCR).
- Yersinia enterocolítica – Cultivo; Identificación molecular de cepas patogenas; Identificación molecular de los principales serotipos.
- Yersinia pestis - Cultivo; Diagnóstico molecular (PCR).
- Yersinia pseudotuberculosis - Anticuerpos.
- Zika, Virus ..., (ZIKV: Zika virus) (Flavivirus, Flaviviridae) (Arbovirus) – Diagnóstico molecular por PCR en tiempo real (Real Time PCR) y por detección de anticuerpos (serología) específicos mediante pruebas de neutralización.
- Zygomycetes (Mucorales - Mucormicosis: Examen microscópico; Cultivo; Diagnóstico molecular (PCR); Identificación molecular (secuenciación); Diagnóstico molecular de Absidia spp., Cunninghamella spp., Mucor spp., Rhizopus spp., Rhizomucor spp