Microbiología de aguas
- Aerobios mesófilos a 22ºC y a 37ºC
- Aliivibrio (Vibrio) fischeri: Cultivo cualitativo y cuantitativo; Identificación presuntiva por bioluminiscencia; Identificación molecular (secuenciación).
- Análisis de agua o sedimentos de plantas de tratamientos de aguas residuales para ciliados móviles y sésiles, amebas, flagelados y bacterias filamentosas: examen microscópico cualitativo (contraste de fases) y tras tinciones; Contaje por unidad de
- Arcobacter spp. - Interés en patología humana y animal y en fuentes de contaminación (aguas o alimentos de origen animal): cultivo e identificación molecular (PCR y secuenciación).
- Microthrix parvicella: Aislamiento en cultivo; Diagnóstico molecular (PCR); Identificación molecular (secuenciación).
- Pasteurella spp. en aguas: Diagnóstico molecular (PCR).
- Bacteriófagos en aguas - (Ver: Colifagos en agua en Área de Microbiología de aguas).
- Beggiatoa spp. - Detección cualitativa molecular por PCR e identificación por secuenciación.
- Bryozoa (Briozoos) en aguas dulces. Animales coloniales causantes de obstrucciones en conducciones de aguas: observación microscópica; Identificación molecular de especies.
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Burkholderia pseudomallei (Ver: Burkholderia pseudomallei
en área de Microbiología clínica). - Clostridium sulfitorreductores.
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Colifagos en aguas: indicadores virales alternativos a los indicadores bacterianos. Métodos cualitativo y cuantitativo (EPA 1601
y EPA 1602 , para colifagos machos F+ y somáticos F-). - Coliformes fecales
- Coliformes totales.
- Cryptosporidium parvum - Detección de ooquistes tras concentración.
- Eikelboom 021N (Thiothrix eikelboomii, Thiolinea disciformis, Thiofilum flexile): Aislamiento en cultivo; Diagnóstico molecular (PCR); Identificación molecular (secuenciación).
- Endotoxinas bacterianas por prueba de LAL (Limulus Amebocyte Lysate) en aguas y soluciones acuosas de uso médico. Acreditada por ENAC.
- Enterobacterias.
- Enterococcusspp. - Detección, recuento e identificación.
- Enterovirus - Cultivo y detección molecular (PCR)
- Escherichia coli - Detección, recuento e identificación.
- Escherichia coli (O157:H7)
- Estreptococos fecales (enterococos) - (Ver Enterococcus spp)
- Giardia spp., detección de quistes
- Giardia spp. y Cryptosporidium spp. en aguas: quistes de Giardia spp. y ooquistes de Cryptosporidium spp. en muestras de aguas.
- Helicobacter pylori en aguas
- Helmintos, detección de huevos de nematodos, cestodos (Taenia spp.) o trematodos en aguas de superficie o residuales: separación por métodos de concentración; observación microscópica; Identificación molecular (secuenciación).
- Legionella pneumophila, cultivo, según normas ISO 11731: 1998 y 11731-2: 2004.
- Legionella pneumophila, PCR
- Leptospira spp.: pruebas para detección de Leptospira spp. en aguas .
- Microorganismos degradadores de ETBE (Ethyl Tert-Butyl Ether): Detección e identificación en aguas y suelos.
- Microorganismos degradadores de hidrocarburos TPH-GRO (Total Petroleum Hidrocarbon-Gasoline Range Organics): Detección e identificación en aguas y suelos.
- Microorganismos degradadores de MTBE (Methyl Tert-Butyl Ether): Detección e identificación en aguas y suelos.
- Microorganismos filamentosos de lodos y EDAR: Cultivo tras tratamiento de muestras, incubación prolongada, observación microscópica, resiembra posterior de colonias aisladas; Identificación molecular de diferentes morfotipos (secuenciación).
- Molluscum contagiosum, Virus del …, - Detección en aguas de piscinas y otros sistemas hídricos compartidos (Ver Molluscum contagiosum, Virus de ..., en área de Microbiología clínica).
- Mycobacterium chelonae en aguas: Diagnóstico molecular (PCR).
- Mycobacterium immunogenum (Complejo Mycobacteium chelonae-Mycobacterium abscessus) - Implicaciones en la industria metalúrgica y relacionada, y en infecciones hospitalarias: Cultivo; PCR en tiempo real cualitativa o cuantitativa; Identificac
- Nematodos, Huevos de nematodos en aguas residuales: Concentración; Recuento; Identificación molecular de especies (PCR y secuenciación).
- Nemátodos y larvas (método de Baerman)
- Norovirus y Sapovirus (Caliciviridae) (Ver Norovirus y Sapovirus en área de Microbiología de alimentos).
- Ooquistes de Coccidia (Cryptosporidium spp. y Cystoisospora spp.) en aguas
- Poliovirus, cultivo
- Poliovirus, PCR
- Prototheca spp. - Interés en patología humana y animal y en fuentes de contaminación (muestras ambientales, alimentos, y muestras de origen animal): Cultivo e identificación molecular (PCR y secuenciación).
- Vibrio cholerae - (Ver en área de Microbiología clínica: Vibrio cholerae cholerae biotipo clásico; Vibrio cholerae biotipo El Tor; Serogrupos O1 y O139 -Bengal-, y Vibrio cholerae NAG (no-O1, No-O139).
- Vibrio parahaemolyticus
- Vibrios (otros)
- Virus transmitidos por aguas y alimentos: Calicivirus (Norovirus y Sapovirus), Rotavirus, Enterovirus, Hepatitis A, Hepatitis E, Adenovirus humanos intestinales y Astrovirus. Detección molecular mediante RT-PCR o PCR en tiempo real (Real time-PCR),