Microbiología vegetal

  1. Acidovorax spp.: Diagnóstico molecular (PCR).
  2. Agrobacterium tumefaciens: Cultivo y amplificación de ADN (PCR convencional)
  3. Ajos y otras especie de Allium, Virus de ..., (ajos, cebollas, puerros, chalotas) - Detección molecular (RT-PCR) e identificación (secuenciación).
  4. Ácaros eriófidos del tomate: detección microscópica e identificación molecular (PCR y secuenciación).
  5. Bacillus thuringiensis - Interés como agente para biocontrol de plagas con posibles repercusiones humanas: Cultivo cuantitativo; Identificación molecular (PCR y secuenciación).
  6. Bacterias del hierro: Cultivo; Diagnóstico molecular (PCR y secuenciación).
  7. Bacterias fijadoras de nitrógeno atmosférico (Azotobacter spp. y Azospirillum spp.): Aislamiento en cultivo; Amplificación de ADN (PCR).
  8. Bacterias nitrificantes (AOB -Amonio-oxidantes- y NOB -Nitrito-oxidantes-: PCR en tiempo real cuantitativa.
  9. Bacterias reductoras de sulfato: Diagnóstico molecular (PCR).
  10. Bacterias solubilizadoras de fosfatos: Aislamiento en cultivo; Identificación Molecular (PCR y secuenciación).
  11. Bronceado del tomate, Virus del ..., (TSWV - Tomato Spotted Wilt virus): RT-PCR (Transcripción reversa y PCR de ADNc).
  12. Cadophora spp.: Patógenos de plantas, colonizadores de troncos y raíces, y saprofitos de la madera – Cultivo; Identificación molecular (PCR y secuenciación).
  13. Ceratocystis fimbriata: Diagnóstico molecular (PCR).
  14. Cerveza alterada por microorganismos: Detección del/de los microorganismo/s implicado/s por métodos moleculares (PCR), e identificación de especie por secuenciación
  15. Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis - Agente causal del marchitamiento bacteriano y chancro del tomate: Diagnóstico molecular (PCR).
  16. Clorosis de los cítricos (Xylella fastidiosa): Diagnóstico molecular (PCR).
  17. Coniella diplodiella (syn. Pilidiella diplodiella, Coniothyrium diplodiella)- antracnosis de la vid, podredumbre blanca de la vid: Cultivo; Diagnóstico molecular (PCR y secuenciación).
  18. Costra de los cítricos (Elsinoe fawcettii): Diagnóstico molecular (PCR).
  19. Cyclospora cayetanensis: Diagnóstico molecular (PCR); Detección molecular en frutas o verduras (PCR).
  20. Datura stramoniun (estramonio)
  21. Deformación infecciosa de la vid, Virus de la ..., (hoja en abánico y mosaico amarillo) (Grapevine Fanleaf virus, GFLV): Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  22. Degradación de cerveza por Lactobacillus brevis y/o Lactobacillus lindneri - Diagnóstico molecular (PCR); Identificación molecular (secuenciación); Cultivo cuantitativo.
  23. Ditylenchus destructor - Observación e identificación microscópica o molecular.
  24. Ditylenchus dipsaci - Observación e identificación microscópica o molecular
  25. Erwinia chrysanthemi pv.(syn.Pectobacterium chrysanthemi pv). Dickeya chrysantemi, D.dianthicola, D.dadantii, D.zeae, D.chrysanthemi, D.dieffenbachiae, D.paradisiaca, D.solani–Cultivo;Diagnóstico molecular (PCR, secuenciaci
  26. Frankliniella occidentalis - Observación e identificación microscópica
  27. Fusarium oxysporum: Aislamiento en cultivo; Diagnóstico molecular (PCR).
  28. Fusarium spp. - Importancia hortofrutícola. Detección de especies patógenas por métodos moleculares
  29. GFkV (Grapevine Fleck virus) - Grupo IV, (+) ssRNA, Género Maculavirus, Familia Tymoviridae: Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  30. GFLV (Grapevine Fanleaf virus) - Grupo IV, (+) ssRNA, Género Nepovirus, Familia Secoviridae, Subfamilia Comovirinae: Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  31. GLRaV (Grapevine Leafroll associated viruses) tipos 1, 2, 3, 4, 5, 7 y 9 - Grupo IV, (+) ssRNA, Género Ampelovirus, Familia Closteroviridae: Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  32. GPGV (Grapevine Pinot Gris virus) - Grupo IV (+) ssRNA, Género Trichovirus, Familia Betaflexiviridae: Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  33. GRGV (Grapevine Red Globe virus) - Grupo IV (+) ssRNA, Género Maculavirus, Familia Tymoviridae: Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  34. GRSPaV (Grapevine Rupestris Stem-Pitting Associated virus) - Grupo IV (+) ssRNA, Género Foveavirus, Familia Betaflexiviridae: Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  35. GRVFV (Grapevine Rupestris Vein Feathering Virus) - Grupo IV (+) ssRNA, Género Maculavirus, Familia Tymoviridae: Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  36. GSyV-I (Grapevine Syrah virus-I) - Grupo IV (+) ssRNA, Género Marafivirus, Familia Tymoviridae: Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  37. GVA y GVB (Grapevine virus A and B) - Grupo IV, (+) ssRNA, Género Vitivirus, Familia Betaflexiviridae: Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  38. Hongos fitopatógenos: Aislamiento en cultivo; Identificación molecular (PCR y secuenciación.
  39. Leptosphaeria maculans - Chancro del tallo y pie negro de las plantas crucíferas: Diagnóstico molecular (PCR).
  40. Mancha negra de los cítricos (Phyllostica citricarpa) (Citrus Black Spot): Diagnóstico molecular (PCR).
  41. Megasphaera cerevisiae: Diagnóstico molecular (PCR).
  42. Mildiu de patatas y tomates (Ver Phytophthora infestans).
  43. Phytophthora infestans - Mildiu de patatas y tomates
  44. Monilinia spp.: Diagnóstico molecular (PCR).
  45. Mosaico de Arabis, Virus del ..., (ArMV: Arabis Mosaic Virus): RT-PCR (Transcripción reversa y PCR de ADNc)
  46. Mosaico de la coliflor, Virus del ..., (CaMV) - Plantas crucíferas: Diagnóstico molecular (PCR).
  47. Virus del Mosaico de la lechuga (LMV: Lettuce Mosaic virus): Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  48. Mosaico del nabo (TuMV) - Infección en plantas de familia Brassicaceae: Diagnóstico molecular (RT-PCR)
  49. Mosaico del tomate, Virus del ..., (ToMV: Tomato Mosaic virus): Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  50. Nematodos fitopatógenos: Aislamiento de suelos (tierra); Identificación molecular (PCR y secuenciación).
  51. Nymphaea spp.: Identificación molecular (PCR y secuenciación).
  52. Oenococcus oeni: Cultivo cuantitativo; Diagnóstico molecular (PCR).
  53. Papaya (Carica papaya) – Identificación de sexo hemafrodita, femenino o macho por métodos moleculares
  54. Peach Rosette Mosaic virus (syn. Peach Rosette Mosaic Nepovirus) (PRMV): Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  55. Pectinatus spp.: Diagnóstico molecular (PCR).
  56. Pepino Mosaic virus (pepMV), Familia Alphaflexiviridae, Género Potexvirus, (+) ssRNA: Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  57. Pepino, virus del mosaico del pepino (CMV, Cucumber Mosaic virus), Familia Bromoviridae, género Cucumovirus, (+) ssRNA: Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  58. Phytophthora ramorum - Diagnóstico molecular (PCR).
  59. Phytoplasma spp. - Diagnóstico molecular (PCR); Identificación molecular (PCR y secuenciación).
  60. Pseudomonas luteola (antes Chryseomonas luteola): Aislamiento en cultivo; Identificación molecular (PCR y secuenciación).
  61. Pyricularia grisea (Magnaporthe grisea) - Interés actual. Infección del arroz y otras gramináceas (trigo, centeno, cebada, mijo, y césped). Pruebas diagnósticas
  62. Ralstonia solanacearum, un patógeno vegetal importante: cultivo y/o PCR
  63. Raspberry Ringspot virus (RpRSV): Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  64. Rhizobium spp. (Ver Rhizobium spp.: Aislamiento en cultivo cuantitativo; Detección molecular (PCR); Identificación molecular de especies (PCR y secuenciación) en Sección de Microbiología de abonos y fertilizantes).
  65. Rhizoglyphus echinopus – Observación e identificación microscópica.
  66. Sexo de plantas – Plantas machos, hembras y hermafroditas: Determinación del sexo por métodos moleculares (PCR y RAPD).
  67. Strawberry Latent Ringspot virus: Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  68. Streptomyces spp.: Cultivo; Diagnóstico molecular (PCR).
  69. Tobacco Ringspot virus (TRSV): Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  70. Tobamovirus, Familia Virgaviridae, (+) ssRNA: Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  71. Tomato Black Ring virus (TBRV): Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  72. Tomato Brown Rugose Fruit virus ((ToBRFV): Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  73. Tomato Ringspot virus (ToRSV): Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  74. Transgénicos - PCR
  75. Trichoderma spp.: Diagnóstico molecular (PCR).
  76. Tristeza de los cítricos, Virus de la ..., (Citrus Tristeza virus –CTV-): Detección molecular por RT-PCR.
  77. Tuber melanosporum y otras especies de trufas - Identificación microscópica; Identificación molecular (PCR y secuenciación).
  78. Venas gruesas de la lechuga, virus de las ..., (LBVV: Lettuce big-vein virus): Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  79. Verticilliun dahliae y otras especies de Verticillium – Marchitez por …, (Verticilosis) - Diagnóstico molecular cuantitativo y cuantitativo (PCR y qrtPCR); Identificación molecular (secuenciación).
  80. Verticilosis (Ver Verticillium dahliae y otras especies de Verticillium).
  81. Virus de la hoja amarilla rizada del tomate (TYLCV: Tomato yellow leaf curl virus) Begomovirus, Familia Geminiviridae: Diagnóstico molecular (PCR).
  82. Virus de la vid (Ver: GFkV, GLRaV, GPGV, GRGV, GRSPaV, GRVFV, GSyV-I, GVA, GVB).
  83. Xantomonas spp., Xantomonas campestris pv. campestris, Xanthomonas euvesicatoria, Xantomonas vesicatoria, Xanthomonas perforans, Xanthomonas gardneri: Diagnóstico molecular (PCR).
  84. Xylella fastidiosa: Aislamiento en cultivo; Diagnóstico molecular (PCR).
  85. Xylophilus ampelinus (Necrosis bacteriana de la vid): Diagnóstico molecular (PCR).
  86. Zymomonas mobilis en bebidas (Cerveza, sidra, ...): Aislamiento en cultivo; Diagnóstico molecular (PCR).