Microbiología vegetal

  1. Ácaros eriófidos del tomate: detección microscópica e identificación molecular (PCR y secuenciación).
  2. Acidovorax spp.: Diagnóstico molecular (PCR).
  3. Agrobacterium tumefaciens: Cultivo y amplificación de ADN (PCR convencional)
  4. Ajos y otras especie de Allium, Virus de ..., (ajos, cebollas, puerros, chalotas) - Detección molecular (RT-PCR) e identificación (secuenciación).
  5. Alicyclobacillus spp.: Cultivo cuantitativo, Identificación, Diagnóstico molecular (PCR y secuenciación).
  6. Antracnosis - Enfermedad por hongos de varios géneros y especies específicos de planta hospedadora: Aislamiento en cultivo; Diagnóstico molecular; Identificación de especie (secuenciación).
  7. Arabis Mosaic Virus (ArMv) Grupo IV, (+) ssRNA, Secoviridae, Nepovirus - Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  8. Bacillus licheniformis: Cultivo cuantitativo, Identificación, Diagnóstico molecular (PCR y secuenciación).
  9. Bacillus thuringiensis - Interés como agente para biocontrol de plagas con posibles repercusiones humanas: Cultivo cuantitativo; Identificación molecular (PCR y secuenciación).
  10. Bacterias del hierro: Cultivo; Diagnóstico molecular (PCR y secuenciación).
  11. Bacterias fijadoras de nitrógeno atmosférico (Azotobacter spp. y Azospirillum spp.): Aislamiento en cultivo; Amplificación de ADN (PCR).
  12. Bacterias nitrificantes (AOB -Amonio-oxidantes- y NOB -Nitrito-oxidantes-: PCR en tiempo real cuantitativa.
  13. Bacterias reductoras de sulfato: Diagnóstico molecular (PCR).
  14. Bacterias solubilizadoras de fosfatos: Aislamiento en cultivo; Identificación Molecular (PCR y secuenciación).
  15. Blueberry Leaf Mottle virus (BLMoV) - Grupo IV, (+)ssRNA, Secoviridae, Nepovirus: Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  16. Bronceado del tomate, Virus del ..., (TSWV - Tomato Spotted Wilt virus): RT-PCR (Transcripción reversa y PCR de ADNc).
  17. Cactus Carlavirus 2 (CCV2) - Grupo IV, (+)ssRNA, Betaflexiviridae, Carlavirus: Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  18. Cactus virus X (CVX) y Cactus Carlavirus 2 (CCV2). Familias Alphaflexiviridae y Betaflexiviridae (ssRNA): Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  19. Cadophora spp.: Patógenos de plantas, colonizadores de troncos y raíces, y saprofitos de la madera – Cultivo; Identificación molecular (PCR y secuenciación).
  20. Candidatus Liberibacter asiaticus y Candidatus Liberibacter africanus: Diagnóstico molecular (PCR).
  21. Candidatus Phytoplasma: Diagnóstico molecular (PCR).
  22. Ceratocystis fimbriata: Diagnóstico molecular (PCR).
  23. Cerveza alterada por microorganismos: Detección del/de los microorganismo/s implicado/s por métodos moleculares (PCR), e identificación de especie por secuenciación
  24. Chaetosiphon fragaefolii (pulgón de fresa): Examen microscópico; diagnóstico molecular (PCR) e identificación de especie (PCR y secuenciación).
  25. Cirsium arvense: Diagnóstico molecular (PCR).
  26. Citrus exocortis viroide (CEV): Diagnóstico molecular (RT-PCR)
  27. Citrus psorosis virus (CPsV) - Aspiviridae, Ophiovirus, y Citrus Variegation virus (CVV) - Bromoviridae, Ilarvirus: Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  28. Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis - Agente causal del marchitamiento bacteriano y chancro del tomate: Diagnóstico molecular (PCR).
  29. Clorosis de los cítricos (Xylella fastidiosa): Diagnóstico molecular (PCR).
  30. Colletotrichum spp. (C. fragariae, C. acutatum, C. gloeosporoides, etc.): Diagnóstico molecular (PCR); Identificación de especie (PCR y secuenciación).
  31. Coniella diplodiella (syn. Pilidiella diplodiella, Coniothyrium diplodiella)- antracnosis de la vid, podredumbre blanca de la vid: Cultivo; Diagnóstico molecular (PCR y secuenciación).
  32. Costra de los cítricos (Elsinoe fawcettii): Diagnóstico molecular (PCR).
  33. Cronobacter sakazakii (f. sp. Enterobacter sakazakii): Diagnostico molecular (PCR).
  34. Cuscuta spp.: Diagnóstico molecular (PCR).
  35. Cyclospora cayetanensis: Diagnóstico molecular (PCR); Detección molecular en frutas o verduras (PCR).
  36. Dasheen Mosaic virus: Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  37. Datura stramoniun (estramonio)
  38. Deformación infecciosa de la vid, Virus de la ..., (hoja en abánico y mosaico amarillo) (Grapevine Fanleaf virus, GFLV): Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  39. Degradación de cerveza por Lactobacillus brevis y/o Lactobacillus lindneri - Diagnóstico molecular (PCR); Identificación molecular (secuenciación); Cultivo cuantitativo.
  40. Dickeya spp. (ver Erwinia spp., Pectobacterium spp.)
  41. Ditylenchus destructor - Observación e identificación microscópica o molecular.
  42. Ditylenchus dipsaci - Observación e identificación microscópica o molecular
  43. Erwinia chrysanthemi pv.(syn.Pectobacterium chrysanthemi pv). Dickeya chrysantemi, D.dianthicola, D.dadantii, D.zeae, D.chrysanthemi, D.dieffenbachiae, D.paradisiaca, D.solani–Cultivo;Diagnóstico molecular (PCR, secuenciaci
  44. Frankliniella occidentalis - Observación e identificación microscópica
  45. Fusarium oxysporum: Aislamiento en cultivo; Diagnóstico molecular (PCR).
  46. Fusarium oxysporum f. sp. lycoperdici (FOL) y Fusarium oxysporum f. sp. radicis lycoperdici (FORL): Diagnóstico molecular (PCR).
  47. Fusarium proliferatum: Diagnóstico molecular (PCR).
  48. Fusarium spp. - Importancia hortofrutícola. Detección de especies patógenas por métodos moleculares
  49. Garlic Common Latent virus (GarCLV) (virus común latente del ajo): Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  50. GFkV (Grapevine Fleck virus) - Grupo IV, (+) ssRNA, Género Maculavirus, Familia Tymoviridae: Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  51. GFLV (Grapevine Fanleaf virus) - Grupo IV, (+) ssRNA, Género Nepovirus, Familia Secoviridae, Subfamilia Comovirinae: Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  52. Globodera rostochiensis y Globodera pallida (Potato cyst nematode): Examen microscópico; Detección molecular (PCR).
  53. GLRaV (Grapevine Leafroll associated viruses) tipos 1, 2, 3, 4, 5, 7 y 9 - Grupo IV, (+) ssRNA, Género Ampelovirus, Familia Closteroviridae: Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  54. GPGV (Grapevine Pinot Gris virus) - Grupo IV (+) ssRNA, Género Trichovirus, Familia Betaflexiviridae: Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  55. GRGV (Grapevine Red Globe virus) - Grupo IV (+) ssRNA, Género Maculavirus, Familia Tymoviridae: Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  56. GRSPaV (Grapevine Rupestris Stem-Pitting Associated virus) - Grupo IV (+) ssRNA, Género Foveavirus, Familia Betaflexiviridae: Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  57. GRVFV (Grapevine Rupestris Vein Feathering Virus) - Grupo IV (+) ssRNA, Género Maculavirus, Familia Tymoviridae: Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  58. GSyV-I (Grapevine Syrah virus-I) - Grupo IV (+) ssRNA, Género Marafivirus, Familia Tymoviridae: Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  59. GVA y GVB (Grapevine virus A and B) - Grupo IV, (+) ssRNA, Género Vitivirus, Familia Betaflexiviridae: Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  60. High Plains virus (HPV) = Wheat mosaic virus (WMoV): Diagnóstico molecular (RT-PCR)
  61. Hongos fitopatógenos: Aislamiento en cultivo; Identificación molecular (PCR y secuenciación.
  62. Iris Yellow Spot virus (IYSV) Grupo V, (-)ssRNA, Bunyaviridae, Tospovirus: Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  63. Leek Yellow Stripe virus (LYSV) (Virus del bandeo amarillo del puerro): Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  64. Leptosphaeria maculans - Chancro del tallo y pie negro de las plantas crucíferas: Diagnóstico molecular (PCR).
  65. Leuconostoc spp. y Leuconostoc citreum: Diagnóstico molecular (PCR).
  66. Liberibacter solanacearum: Diagnóstico molecular (PCR)
  67. Maize Chlorotic Dwarf virus (MCDV): Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  68. Maize Chlorotic Mottle virus (MCMV): Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  69. Maize Dwarf Mosaic virus (MDMV): Diagnóstico molecular (RT-PCR)
  70. Maize Rough Dwarf virus (MRDV): Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  71. Maize Streak virus (MSV): Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  72. Mancha negra de los cítricos (Phyllostica citricarpa) (Citrus Black Spot): Diagnóstico molecular (PCR).
  73. Megasphaera cerevisiae: Diagnóstico molecular (PCR).
  74. Melon Necrotic Spot Virus (MNSV): Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  75. Methylobacterium spp. - bacteria ubicua, promotora del crecimiento de plantas y patógena oportunista humana: Cultivo cualitativo y cuantitativo; Diagnóstico molecular (PCR) e identificación de especies (PCR y secuenciac
  76. Mildiu de patatas y tomates (Ver Phytophthora infestans).
  77. Phytophthora infestans - Mildiu de patatas y tomates
  78. Monilinia spp.: Diagnóstico molecular (PCR).
  79. Mosaico de Arabis, Virus del ..., (ArMV: Arabis Mosaic Virus): RT-PCR (Transcripción reversa y PCR de ADNc)
  80. Mosaico de la coliflor, Virus del ..., (CaMV) - Plantas crucíferas: Diagnóstico molecular (PCR).
  81. Virus del Mosaico de la lechuga (LMV: Lettuce Mosaic virus): Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  82. Mosaico del nabo (TuMV) - Infección en plantas de familia Brassicaceae: Diagnóstico molecular (RT-PCR)
  83. Mosaico del tomate, Virus del ..., (ToMV: Tomato Mosaic virus): Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  84. Nematodos fitopatógenos: Aislamiento de suelos (tierra); Identificación molecular (PCR y secuenciación).
  85. Nymphaea spp.: Identificación molecular (PCR y secuenciación).
  86. Oenococcus oeni: Cultivo cuantitativo; Diagnóstico molecular (PCR).
  87. Olpidium spp.: Diagnóstico molecular (PCR); Identificación de especie (PCR y secuenciación).
  88. Onion Yellow Dwarf virus (OYDV) (Virus del enanismo amarillo de la cebolla): Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  89. Orobanche spp.: Diagnóstico molecular (PCR).
  90. Paenibacillus larvae: Diagnóstico molecular (PCR).
  91. Papaya (Carica papaya) – Identificación de sexo hemafrodita, femenino o macho por métodos moleculares
  92. PDV (Prune dwarf Ilarvirus) (Grupo IV, (+)ssRNA, Familia Bromoviridae, Género Ilarvirus): Diagnóstico molecular (RT-PCR).PDV (Prune dwarf Ilarvirus) (Grupo IV, (+)ssRNA, Familia Bromoviridae, Género Ilarvirus): Diagnóstico molecular (
  93. Peach Latent Mosaic viroid: Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  94. Peach Rosette Mosaic virus (syn. Peach Rosette Mosaic Nepovirus) (PRMV): Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  95. Pectinatus spp.: Diagnóstico molecular (PCR).
  96. Pepino Mosaic virus (pepMV), Familia Alphaflexiviridae, Género Potexvirus, (+) ssRNA: Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  97. Pepino, virus del mosaico del pepino (CMV, Cucumber Mosaic virus), Familia Bromoviridae, género Cucumovirus, (+) ssRNA: Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  98. Peronospora spp.: Diagnóstico molecular (PCR).
  99. Phythophthora cinnamomi: Diagnóstico molecular (PCR)
  100. Phytium spp.: Diagnóstico molecular (PCR).
  101. Phytonemus pallidus fragariae (ácaro de la fresa): Examen microscópico; Identificación de especie (PCR y secuenciación).
  102. Phytophthora cactorum: Diagnóstico molecular (PCR).
  103. Phytophthora fragariae: Diagnóstico molecular (PCR).
  104. Phytophthora ramorum - Diagnóstico molecular (PCR).
  105. Phytoplasma spp. - Diagnóstico molecular (PCR); Identificación molecular (PCR y secuenciación).
  106. Phytoplasmas (Aster Yellows Phytoplasma; Clover Phyllody Phytoplasma; Strawberry Lethal Yellows disease; Strawberry Green Petal diseases; Strawberry Witchs Broom Phytoplasma): Diagnóstico molecular (PCR); Identificación de especie (PCR y secuenciac
  107. Plasmodiophora brassicae: Diagnóstico molecular (PCR).
  108. Pluribacter gergoviae: Cultivo cuantitativo, Identificacion, Diagnóstico molecular (PCR y secuenciación) (Ver Enterobacter gergoviae).
  109. PNRSV (Prunus Necrotic Ringspot Ilarvirus), Grupo IV, (+)ssRNA, Familia Bromoviridae, Género Ilarvirus: Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  110. Potato Latent virus (PotLV): Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  111. Potato Mop-Top virus (PMTV): Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  112. Potato virus Y (PVY) - Potyviridae. Potyvirus, (+)ssRNA: Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  113. PPV (Plum Pox Potyvirus), Grupo IV, (+)ssRNA, Familia Potyviridae, Género Potyvirus: Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  114. Pseudomonas luteola (antes Chryseomonas luteola): Aislamiento en cultivo; Identificación molecular (PCR y secuenciación).
  115. Pseudomonas syringae pv morsprunorum. Familia Pseudomonadaceae, Género Pseudomonas, Especie Pseudomonas syringae, Patovariedades: Diagnóstico molecular (PCR).
  116. Pyricularia grisea (Magnaporthe grisea) - Interés actual. Infección del arroz y otras gramináceas (trigo, centeno, cebada, mijo, y césped). Pruebas diagnósticas
  117. Ralstonia solanacearum, un patógeno vegetal importante: cultivo y/o PCR
  118. Raspberry Ringspot virus (RpRSV): Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  119. Rhizobium spp. (Ver Rhizobium spp.: Aislamiento en cultivo cuantitativo; Detección molecular (PCR); Identificación molecular de especies (PCR y secuenciación) en Sección de Microbiología de abonos y fertilizantes).
  120. Rhizoglyphus echinopus – Observación e identificación microscópica.
  121. Rhizomonas suberifaciens (sin. Sphingomonas suberifaciens, Rhizohapis suberifaciens): Diagnóstico molecular (PCR).
  122. Sexo de plantas – Plantas machos, hembras y hermafroditas: Determinación del sexo por métodos moleculares (PCR y RAPD).
  123. Sphaerosporella brunnea: Diagnóstico molecular (PCR).
  124. Spiroplasma citri: Diagnóstico molecular (PCR).
  125. Spongospora subterranea: Diagnóstico molecular (PCR).
  126. Strawberry Crinkle virus: Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  127. Strawberry Latent Ringspot virus: Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  128. Strawberry mild yellow edge virus (SMYEV): Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  129. Streptomyces scabies, S. acidiscabies, S. turgidiscabies, S. europaeiscabiei, S. stelliscabiei, S. reticuliscabiei, S. luridiscabiei, S. niveiscabiei, S. puniciscabiei, …: Diagnóstico molecular (PCR); Identificación de especie (PCR y secuenc
  130. Streptomyces spp.: Cultivo; Diagnóstico molecular (PCR).
  131. Sugarcane Mosaic virus (SCMV): Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  132. Synchytrium endobioticum: Diagnóstico molecular (PCR).
  133. Thecaphora solani: Diagnóstico molecular (PCR).
  134. Tobacco Ringspot virus (TRSV): Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  135. Tobamovirus, Familia Virgaviridae, (+) ssRNA: Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  136. Tomato Black Ring virus (TBRV): Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  137. Tomato Brown Rugose Fruit virus ((ToBRFV): Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  138. Tomato Bushy Stunt virus: Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  139. Tomato Ringspot virus (ToRSV): Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  140. Transgénicos - PCR
  141. Trichoderma spp.: Diagnóstico molecular (PCR).
  142. Tristeza de los cítricos, Virus de la ..., (Citrus Tristeza virus –CTV-): Detección molecular por RT-PCR.
  143. Tuber melanosporum y otras especies de trufas - Identificación microscópica; Identificación molecular (PCR y secuenciación).
  144. Venas gruesas de la lechuga, virus de las ..., (LBVV: Lettuce big-vein virus): Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  145. Verticilliun dahliae y otras especies de Verticillium – Marchitez por …, (Verticilosis) - Diagnóstico molecular cuantitativo y cuantitativo (PCR y qrtPCR); Identificación molecular (secuenciación).
  146. Verticilosis (Ver Verticillium dahliae y otras especies de Verticillium).
  147. Viroide Potato Spindle Tuber (Viroide del tubérculo en husillo de la patata): Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  148. Virus de la hoja amarilla rizada del tomate (TYLCV: Tomato yellow leaf curl virus) Begomovirus, Familia Geminiviridae: Diagnóstico molecular (PCR).
  149. Virus de la vid (Ver: GFkV, GLRaV, GPGV, GRGV, GRSPaV, GRVFV, GSyV-I, GVA, GVB).
  150. Wheat Mosaic virus (WMoV): Diagnóstico molecular (RT-PCR) .
  151. Wheat Streak Mosaic virus (WSMV): Diagnóstico molecular (RT-PCR).
  152. Xantomonas spp., Xantomonas campestris pv. campestris, Xanthomonas euvesicatoria, Xantomonas vesicatoria, Xanthomonas perforans, Xanthomonas gardneri: Diagnóstico molecular (PCR).
  153. Xylella fastidiosa: Aislamiento en cultivo; Diagnóstico molecular (PCR).
  154. Xylophilus ampelinus (Necrosis bacteriana de la vid): Diagnóstico molecular (PCR).
  155. Zymomonas mobilis en bebidas (Cerveza, sidra, ...): Aislamiento en cultivo; Diagnóstico molecular (PCR).