Virus de hepatitis A (Picornaviridae, Hepatovirus): Diagnóstico molecular (RT-PCR) y tipado molecular (secuenciación).

Picornaviridae (Enterovirus A, B, C, D, E, F, G, H, J; Rhinovirus A, B y C; Hepatovirus; Kobuvirus –virus Aichi-; Parechovirus; Cardiovirus; Aphthovirus; Cosavirus; …..) (antes Poliovirus, Coxsackie A y B, Echovirus, …).Diagnóstico molecular (RT-PCR) y tipado molecular (secuenciación) 
 

Información 08-04-14.

Picornaviridae (Picornavirus)

El virus de la hepatitis A, es el causante de la infección más grave relacionada con el consumo de moluscos bivalvos, produciendo brotes ocasionales, que afectan a bastantes individuos. Este virus se replica en la mucosa intestinal antes de diseminarse y afectar al hígado, por lo que se elimina por las heces antes de que se haya presentado el cuadro de hepatitis en el paciente.
 

Los Picornaviridae (habitualmente llamados Picornavirus) son unos virus muy numerosos, causantes de enfermedades humanas, en animales, plantas e insectos. Estos virus reciben este nombre por su pequeño tamaño (“pico”) y poseer un genoma de RNA (“pico-rna-virus”). Los Picornavirus causas enfermedades humanas muy distintas, desde procesos respiratorios similares a catarros comunes, a poliomielitis. Estos virus afectan a muchas personas y se encuentran en secreciones respiratorias (saliva, esputo, moco nasal), y heces de personas infectadas. Las especies de cualquiera de las especies de Enterovirus A, B, C, D, o J, se transmiten a través de la vía fecal-oral, y provocan infecciones respiratorias leves (catarros comunes), glosopeda (enfermedad de mano, pie y boca), conjuntivitis hemorrágicas, meningitis asépticas, miocarditis, enfermedad séptica neonatal, y parálisis fláccida.

Se diferenciaron inicialmente dos géneros, Enterovirus y Rhinovirus, basándose en la capacidad de infectar el tracto entérico (por replicarse a 37ºC y ser estables a pH ácido gástrico), o en su capacidad de infectar únicamente nariz y faringe (por replicarse a 33ºC e inactivarse a pH ácido). Los Enterovirus se diferenciaron según su patogenia en cuatro grupos: poliovirus, Coxsackie A (CA), Coxsackie B (CB) y Echovirus (Enteric Cytopathogen Human Orphan). Sin embargo, la superposición de características ha motivado su reclasificación, actualmente basada en estudios filogenéticos. Como ejemplo, los Poliovirus, antes considerada una especie dentro del género Enterovirus, actualmente se considera tres serotipos de la especie Enterovirus humano C. De igual forma, los serotipos de Coxsackie A se han distribuido entre la especie Enterovirus humanos A y Enterovirus humano C. El grupo de Coxsackie B (CB 1 a 6), igual que los 28 serotipos de Echovirus (E1 a E33, excepto 8, 10, 22, 23 y 28), se consideran serotipos de la especie Enterovirus humano B. De igual forma, algunos de los serotipos anteriores de Enterovirus (EV-A71, y otros) se consideran serotipos de la especie Enterovirus humano A, mientras que otros serotipos se consideran incluidos en la especie Enterovirus humano B, otros en la especie Enterovirus humano C, otros en la especie Enterovirus humano, D y otros en la especie J. De la misma forma los más de 100 serotipos de Rhinovirus han sido distribuidos en tres especies (Rhinovirus A, B y C). Actualmente, su número se ha incrementado mucho y continúan describiéndose especies que no pertenecen a ninguno de los géneros admitidos hasta ahora (por ejemplo Kosavirus, Cosavirus, Parechovirus, …).
 

Principales enfermedades causadas por Enterovirus:

Resfriado común; Enfermedad febril inespecífica; Meningitis aséptica; Enfermedad de Bornholm o pleurodinia epidémica; Pericarditis y/o myocarditis; Conjuntivitis hemorrágica aguda; Herpangina; Glosopeda; Encefalitis; Hepatitis A; Poliomielitis;  Síndrome Polio-like; Síndrome de fatiga crónica; Diabetes mellitus tipe 1.

Procesos causados por Hepatovirus (virus de hepatitis A)

Hepatitis vírica A.

Procesos causados por Kobuvirus (virus Aichi – Aichivirus, 3 serotipos)

Gastroenteritis por Aichivirus serotipo 1 (AiV1).

Procesos causados por Parechovirus (Human Parechovirus, 14 serotipos, HPeV 1-14)

     Gastroenteritis leves; Infecciones respiratorias leves; Miocarditis;

      Encefalitis.

Procesos causados por Cosavirus (24 serotipos)

Gastroenteritis diarreica.

Procesos causados por Cardiovirus (Encephalomyocarditis virus, 2 tipos – EMCV 1 & 2; Theilovirus, 12 tipos).

Encephalomiocarditis (EMC 1 & 2); Vilyuisk encephalomyelitis virus

(Theilovirus): encefalitis de Vilyuisk; Saffold virus (SAFV) (Theilovirus).

Transmisión de Picornaviridae (Picornavirus)

Contacto directo persona a persona por secreciones respiratorias,

conjuntivales, ….; Vía feco-oral a través de agua contaminada o de

alimentos contaminados; Contacto indirecto a través de objetos

contaminados.

Pruebas realizadas en IVAMI: 

       En IVAMI podemos realizar el aislamiento de aquellos que son cultivables en las líneas celulares habituales. No obstante, al no poderse cultivar algunos de ellos en las líneas celulares habituales, recomendamos el diagnóstico molecular, realizado mediante una RT-PCR, de genes conservados, y posteriormente la secuenciación del amplicón obtenido para poder definir la especie Enterovirus A a D; Rhinovirus A, B o C; y el tipo de virus causal.

Muestras recomendadas:

            La/s muestra/s depende/n de la patología padecida por el paciente.

  • Gastroenteritis: heces emitidas o muestra rectal, tras atravesar esfínter anal, tomada con torunda de dacrón.
  • Meningitis o encefalitis: líquido cefalorraquídeo obtenido por punción.
  • Infecciones respiratorias: exudado faríngeo o nasofaríngeo con torunda de dacrón.
  • Enfermedad febril inespecífica: exudado faríngeo, o mejor nasofaríngeo, tomado con torunda de dacrón.
  • Herpangina: exudado de lesiones orales tomado con torunda de dacrón.
  • Poliomielitis o síndrome Poliomielitis-like: líquido cefalorraquídeo tomado por punción.
  • Conjuntivitis hemorrágica: exudado conjuntival tomado con torunda de dacrón
  • Pericarditis o miocarditis: líquido pericárdico obtenido por punción.
  • Resfriado con rinitis: exudado nasal tomado con torunda de dacrón.
  • Glosopeda: exudado de lesiones orales tomado con torunda de dacrón.

Tipo de envase:

         Estéril, adecuado al tipo de muestras.

Conservación de las muestras:

         Congeladas y envío refrigerado al laboratorio.

Coste de las pruebas:

        Consultar a ivami@ivami.com