Microorganismos proteolíticos (mesófilos y psicrófilos): Aislamiento en cultivo cuantitativo; Identificación molecular (secuenciación).
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Existen muchos microorganismos proteolíticos que pueden estar implicados, algunos mesófilos y otros psicrófilos pertenecientes varios géneros de bacterias u hongos filamentosos o levaduriformes. Por ejemplo: Acinetobacter spp., Aeromonas spp., Alcaligenes spp., Bacillus spp., Bacterias ácido-lácticas (LAB, principalmente de los géneros Lactobacillus, Pediococcus y Leuconostoc), Brevibacterium spp., Brochothrix thermosphacta, Clostridium spp., Flavobacterium spp., Micrococcus spp., Moraxella spp., Staphylococcus spp., Pseudomonas spp., Psychrobacter spp., algunas bacterias de la familia Enterobacteriaceae, algunos hongos filamentosos (Penicillium spp. y Mucor spp.), y algunas levaduras (p.ej. Debaryomyces hansenii syn. Candida famata).
Ello implica realizar el cultivo en varios medios de cultivos y a su vez para incubar a temperatura de crecimiento para el desarrollo de los mesófilos y a temperaturas más baja para el desarrollo de los psicrófilos.